More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1015 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1015  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 256 aa  522  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0550  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000958325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3172  DNA-binding response regulator  32.48 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2800  response regulator receiver protein  33.77 
 
 		 236 aa  135  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0122786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  32.9 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  32.9 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.9 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1002  two component transcriptional regulator  32.9 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1010  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000199702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3594  transcriptional regulatory protein RstA, putative  33.62 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0878  two component transcriptional regulator  33.76 
 
 		 237 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00260237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  30.04 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1030  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000542446  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3064  response regulator transcription regulator protein  30.2 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  32.07 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0981  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0593139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0896  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000189871  normal  0.423328 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  29.58 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  29.58 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1144  DNA-binding response regulator  29.17 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  28.33 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1517  DNA-binding response regulator  29.17 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184346  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0096  DNA-binding response regulator  29.17 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0972666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0154  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.13097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  29.54 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  32.05 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2699  response regulator receiver protein  30.64 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.824129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0804  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0162077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  29.11 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  28.81 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2933  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.66 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164541  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  29 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  28.75 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  29.18 
 
 		 234 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01694  two component response regulator transcription regulator protein  29.51 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0473  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.87 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  31.58 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  28.15 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05293  hypothetical protein  29.06 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1032  response regulator  30.17 
 
 		 232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0894814  normal  0.523068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  29.73 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0081  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  30.53 
 
 		 236 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  26.84 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  27.54 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  26.84 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  28.72 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  28.95 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1397  two component transcriptional regulator  32.49 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0231814  hitchhiker  0.000111966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.72 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  27.31 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4494  two component transcriptional regulator  29.05 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  31 
 
 		 229 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.13 
 
 		 227 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1261  two component transcriptional regulator  31.28 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1236  two component transcriptional regulator  31.28 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178062  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4369  two component transcriptional regulator  29.79 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0241221  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0312  putative two component response regulator  32.43 
 
 		 242 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.53 
 
 		 231 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  27.71 
 
 		 248 aa  111  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3677  two component transcriptional regulator  29.06 
 
 		 262 aa  111  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470907 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4886  two component transcriptional regulator  29.36 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000459632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1783  DNA-binding response regulator  29.54 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  24.68 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  28.26 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5349  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656877  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3429  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  29.07 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  32.98 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0936  DNA-binding response regulator  29.79 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  33.51 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0815  DNA-binding response regulator  29.79 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2191  DNA-binding response regulator  29.79 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.82 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0752  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0109076 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  33.51 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  29.57 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.26 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.97 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  29.07 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0844  DNA-binding response regulator  29.79 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0031  DNA-binding response regulator  29.79 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248418  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1592  DNA-binding response regulator  29.79 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  33.51 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  33.51 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  33.51 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0675  two component transcriptional regulator  30.45 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.920274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2145  DNA-binding response regulator  28.45 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  33.71 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  33.71 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  29.71 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  32.98 
 
 		 223 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>