More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1924 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 397 aa  797    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  98.24 
 
 		 397 aa  785    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  56.31 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  53.42 
 
 		 395 aa  428  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  46.95 
 
 		 389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  47.33 
 
 		 387 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  51.77 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  47.85 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  47.44 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  47.95 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  47.95 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  47.95 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  48.46 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  47.95 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  47.95 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  48.72 
 
 		 395 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  47.95 
 
 		 395 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  47.69 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  48.98 
 
 		 398 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  47.18 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  45.9 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  47.73 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  48.61 
 
 		 397 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  47.69 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  46.55 
 
 		 388 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  47.61 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  45.78 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  46.85 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  45.52 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  46.15 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  48.85 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  47.44 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  47.44 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  46.92 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  46.6 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  44.33 
 
 		 397 aa  359  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  45.78 
 
 		 388 aa  358  8e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  46.06 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  46.06 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  45.18 
 
 		 390 aa  356  5e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  45.41 
 
 		 391 aa  355  1e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  43.22 
 
 		 401 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  44.97 
 
 		 400 aa  353  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  45.76 
 
 		 392 aa  352  5.9999999999999994e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  44.72 
 
 		 396 aa  352  7e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  45.11 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  42.97 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  44.08 
 
 		 398 aa  349  6e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  43.7 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  44.47 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  43.15 
 
 		 395 aa  345  5e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  45.15 
 
 		 401 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  42.86 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  44.13 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  44.76 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  42.64 
 
 		 394 aa  342  9e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  43.36 
 
 		 399 aa  341  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  43.47 
 
 		 400 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  43.97 
 
 		 400 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  43.47 
 
 		 400 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  42.59 
 
 		 388 aa  341  2e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  42.36 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  42.18 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  44.22 
 
 		 400 aa  339  4e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  42.46 
 
 		 400 aa  339  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  43.97 
 
 		 400 aa  339  5.9999999999999996e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  41.49 
 
 		 400 aa  338  8e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  42.46 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  44.67 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  44.62 
 
 		 389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  42.71 
 
 		 400 aa  335  7e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  43.97 
 
 		 400 aa  335  7.999999999999999e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  42.42 
 
 		 400 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  43.22 
 
 		 400 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  42.07 
 
 		 400 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  42.78 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  43.47 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  40.67 
 
 		 390 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  42.71 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  41.71 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  40.95 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  42.46 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  42.64 
 
 		 393 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  42.23 
 
 		 392 aa  332  6e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  39.55 
 
 		 396 aa  332  7.000000000000001e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 		 400 aa  332  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  42 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  42.03 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  42.96 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  42.96 
 
 		 400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  41.07 
 
 		 400 aa  329  6e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07471  aminotransferases class-I  43.59 
 
 		 393 aa  329  6e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.503554  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0583  aspartate aminotransferase  45.27 
 
 		 388 aa  329  6e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404967  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  40.97 
 
 		 393 aa  329  7e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  40.86 
 
 		 410 aa  328  8e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  40.15 
 
 		 406 aa  328  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  41.46 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  41.37 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  42.35 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>