More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM02540 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM02540  trehalose transport-related protein, putative  100 
 
 
544 aa  1118    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00828934  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05710  sugar transporter, putative  36.11 
 
 
553 aa  363  4e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.19394  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00713  conserved hypothetical protein  26.88 
 
 
533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00600  trehalose transport-related protein, putative  25.36 
 
 
563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.633366  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02892  MFS sugar permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12040)  25.53 
 
 
525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00460  alpha-glucoside transport-related protein, putative  25.56 
 
 
563 aa  163  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0199479  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29639  maltose permease  26.84 
 
 
581 aa  154  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.175573 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03490  sugar transporter, putative  26.16 
 
 
565 aa  150  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03515  MFS maltose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07240)  25.2 
 
 
530 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31838  maltose permease  26.28 
 
 
585 aa  144  5e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48369  maltose permease  24.81 
 
 
583 aa  140  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04930  trehalose transporter, putative  24.76 
 
 
559 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07866  MFS alpha-glucoside transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11920)  24.9 
 
 
523 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.598686 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05304  MFS alpha-glucoside transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01700)  26.1 
 
 
546 aa  137  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47584  maltose permease  26.76 
 
 
581 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.102505  normal  0.547571 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05917  MFS alpha-glucoside transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10910)  23.49 
 
 
565 aa  131  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832644  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03204  MFS alpha-glucoside transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02650)  24.33 
 
 
540 aa  130  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0163402 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06834  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01340)  24.08 
 
 
555 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00630  trehalose transport-related protein, putative  22.62 
 
 
546 aa  125  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09295  conserved hypothetical protein  24.61 
 
 
512 aa  124  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.970402 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00150  alpha-glucoside:hydrogen symporter, putative  25.97 
 
 
550 aa  120  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02570  receptor, putative  23.7 
 
 
529 aa  117  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.76404  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02601  MFS maltose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00150)  23.64 
 
 
540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32531  maltose permease  22.18 
 
 
509 aa  110  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.931484  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07344  conserved hypothetical protein  24 
 
 
567 aa  110  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0630023  normal  0.669016 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00501  conserved hypothetical protein  25.35 
 
 
539 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0869741  normal  0.401314 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07119  conserved hypothetical protein  22.35 
 
 
619 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.740626 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00060  sugar transporter, putative  21.76 
 
 
555 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01480  hexose transport-related protein, putative  23.8 
 
 
520 aa  106  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02680  glucose transporter, putative  24.56 
 
 
552 aa  104  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03836  conserved hypothetical protein  22.83 
 
 
547 aa  104  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06669  Putative sugar transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AYG1]  22.47 
 
 
534 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000679135  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00020  maltose porter, putative  23.09 
 
 
539 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0123203  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08737  MSTA protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J220]  21.44 
 
 
527 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.187861  normal  0.100961 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01797  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  22.55 
 
 
512 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000141005  normal  0.63949 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00260  sugar transporter, putative  23.28 
 
 
542 aa  93.6  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06923  High-affinity hexose transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874U9]  24.11 
 
 
531 aa  92.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91253  glucose transporter/sensor  23.97 
 
 
528 aa  91.3  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10891  Putative hexose transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2WBH1]  22.97 
 
 
535 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.148796  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02990  sugar transporter, putative  23 
 
 
634 aa  88.6  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03357  Putative monosaccharide sugar transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5F2L5]  23.45 
 
 
550 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.205094  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_27984  Sugar UpTake (tentative)  21.56 
 
 
550 aa  85.5  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_27983  Sugar UpTake (tentative)  21.56 
 
 
550 aa  85.1  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.180127  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04277  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  22.83 
 
 
584 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.851042  normal  0.103558 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66414  hexose transporter  20.4 
 
 
553 aa  84.3  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.730098  normal  0.0488082 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64741  sugar transporter protein  21.16 
 
 
550 aa  82.8  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402333  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07067  conserved hypothetical protein  24.49 
 
 
536 aa  81.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.353327 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01276  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09910)  20.48 
 
 
504 aa  81.6  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.438181 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05734  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06960)  20.86 
 
 
524 aa  80.5  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09173  MFS glucose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00890)  24.51 
 
 
500 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05860  Putative low affinity glucose transporter MstE [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q400D8]  22.4 
 
 
562 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0426596 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55800  High-affinity Glucose Transporter (putative)  20.25 
 
 
542 aa  77.8  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06804  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 
619 aa  77.8  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408533  normal  0.253031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  23.68 
 
 
472 aa  77.4  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10692  conserved hypothetical protein  22.86 
 
 
448 aa  77  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813069  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09168  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  23.9 
 
 
543 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.050203  normal  0.0522811 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05050  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12170)  23.17 
 
 
495 aa  76.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00148453  hitchhiker  0.00000000414532 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02466  MFS glucose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14170)  21.31 
 
 
536 aa  74.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08394  conserved hypothetical protein  31.31 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00212437  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08912  myo-inositol transporter (AFU_orthologue; AFUA_2G07910)  23.99 
 
 
528 aa  73.6  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  24.25 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07667  conserved hypothetical protein  21.06 
 
 
512 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.341465 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33971  Sugar transporter, putative (STL12)  21.74 
 
 
544 aa  72.4  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  21.21 
 
 
492 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05200  hexose transport-related protein, putative  23.61 
 
 
535 aa  72.4  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  22.12 
 
 
507 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  25.52 
 
 
480 aa  72  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12520  predicted protein  22.42 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94159  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  21.62 
 
 
450 aa  70.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  22.11 
 
 
468 aa  70.9  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  23.28 
 
 
468 aa  69.7  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2375  sugar transporter  23.91 
 
 
489 aa  69.3  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00427288  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  23.93 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01138  Quinate permease (Quinate transporter) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P15325]  22.4 
 
 
533 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  26.06 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01940  monosaccharide transporter, putative  22.9 
 
 
599 aa  68.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  24.12 
 
 
493 aa  68.2  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  27.72 
 
 
497 aa  68.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  21.78 
 
 
497 aa  68.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9947  predicted protein  21.92 
 
 
439 aa  68.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  22.06 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  21.2 
 
 
482 aa  67.8  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02585  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05190)  23.18 
 
 
499 aa  67.8  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.253437 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00020  glucose transporter, putative  21.85 
 
 
519 aa  67.8  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  26.22 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08340  hexose transport-related protein, putative  22.31 
 
 
550 aa  67  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  19.66 
 
 
473 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04148  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13080)  23.32 
 
 
548 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.900838  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  24.32 
 
 
480 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  24.32 
 
 
480 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  24.32 
 
 
480 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85501  High-affinity glucose transporter  22.9 
 
 
747 aa  66.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0464607  normal  0.964846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  20.24 
 
 
473 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33008  sugar transporter, high affinity, putative  22.34 
 
 
566 aa  65.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.348655  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  23.7 
 
 
499 aa  65.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  24.11 
 
 
486 aa  65.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06848  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12950)  24.12 
 
 
563 aa  65.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.817086  normal  0.150124 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48420  fructose symporter  24.86 
 
 
511 aa  65.5  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.467105  normal  0.26394 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  23.06 
 
 
509 aa  65.1  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  21.98 
 
 
450 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>