99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI04400 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI04400  kinase, putative  100 
 
 
432 aa  886    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00360  hypothetical protein  76.97 
 
 
462 aa  697    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06207  pyruvate dehydrogenase kinase (AFU_orthologue; AFUA_2G11900)  55.23 
 
 
405 aa  460  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0955633  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90317  predicted protein  44.58 
 
 
517 aa  402  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46874  predicted protein  45.49 
 
 
396 aa  226  8e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183113  normal  0.846713 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50961  predicted protein  44.53 
 
 
357 aa  223  7e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0280626  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13123  predicted protein  37.21 
 
 
328 aa  176  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15081  predicted protein  36.67 
 
 
368 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_09461  pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03240)  27.8 
 
 
442 aa  124  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10800  mitochondrial pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13600)  27.33 
 
 
483 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.403507  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29203  probable pyruvate dehydrogenase kinase  22.43 
 
 
517 aa  86.3  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0107384  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46264  predicted protein  25.55 
 
 
386 aa  79.7  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28836  predicted protein  27.51 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.640365  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  27.56 
 
 
463 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  26.92 
 
 
463 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  26.28 
 
 
463 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  25.15 
 
 
462 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  24.54 
 
 
463 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  24.36 
 
 
461 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  24.36 
 
 
463 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  24.36 
 
 
463 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0813  histidine kinase  26.36 
 
 
587 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.56 
 
 
460 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  25 
 
 
456 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2781  histidine kinase  24.12 
 
 
321 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0290  histidine kinase  28.16 
 
 
333 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  24.36 
 
 
463 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
612 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 
1001 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0701  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
540 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
460 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00933158  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
465 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3068  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
479 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000279575  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2950  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 
378 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37884  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01214  sensor histidine kinase  24.84 
 
 
450 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.699466  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4225  histidine kinase  33.33 
 
 
245 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4375  histidine kinase  32.17 
 
 
246 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821141  decreased coverage  0.0094806 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
581 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
620 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
462 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.76 
 
 
788 aa  46.6  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  25.78 
 
 
482 aa  46.6  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
463 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4673  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
713 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
702 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 
1003 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  27.19 
 
 
572 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.25 
 
 
1171 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2023  histidine kinase  26.98 
 
 
473 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.618926 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  25.85 
 
 
455 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  23.47 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  31.68 
 
 
529 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  23.42 
 
 
473 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  25.85 
 
 
455 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  29.23 
 
 
457 aa  45.8  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.45 
 
 
958 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0246  histidine kinase  27.34 
 
 
473 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 
607 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 
686 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  34.83 
 
 
685 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 
1002 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.76 
 
 
524 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 
457 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  24.14 
 
 
484 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3672  ATP-binding region ATPase domain protein  29.93 
 
 
459 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  24.14 
 
 
484 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.16 
 
 
680 aa  44.3  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
379 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  26.27 
 
 
458 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  25.77 
 
 
774 aa  44.3  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
1178 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.83 
 
 
556 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2267  histidine kinase  25.16 
 
 
488 aa  43.9  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.643176  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
815 aa  43.9  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  24.59 
 
 
540 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2079  sensor histidine kinase  25.81 
 
 
180 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4358  histidine kinase  31.62 
 
 
245 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00933399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  24.14 
 
 
481 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4381  histidine kinase  31.62 
 
 
245 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.030036  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  26.06 
 
 
458 aa  43.5  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 
577 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  25.37 
 
 
800 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  27.87 
 
 
863 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 
487 aa  43.5  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  25.24 
 
 
484 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0667  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
859 aa  43.5  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370657 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 
462 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  30.43 
 
 
489 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
707 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
672 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 
462 aa  43.5  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3727  histidine kinase  24.34 
 
 
457 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.661917  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2792  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
930 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.111634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
766 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
462 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1707  histidine kinase  26.32 
 
 
462 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  27.87 
 
 
621 aa  43.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  33.71 
 
 
580 aa  43.1  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>