281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI04070 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI04070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  100 
 
 		 654 aa  1353    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.434844  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04736  DNA lyase Apn2 (AFU_orthologue; AFUA_3G06180)  32.68 
 
 		 612 aa  207  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.847372  normal  0.290859 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31440  predicted protein  34.2 
 
 		 474 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28317  AP endonuclease  29.5 
 
 		 482 aa  113  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.563607 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  29.86 
 
 		 255 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  29.86 
 
 		 253 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  26.9 
 
 		 251 aa  100  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.6 
 
 		 258 aa  97.1  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  31.95 
 
 		 252 aa  95.5  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  26.64 
 
 		 254 aa  95.1  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  32.39 
 
 		 301 aa  94.7  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  32.74 
 
 		 252 aa  93.2  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  24.2 
 
 		 250 aa  90.5  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  31.18 
 
 		 264 aa  90.1  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  27.08 
 
 		 254 aa  90.1  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  25.36 
 
 		 255 aa  89.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47361  predicted protein  24.06 
 
 		 489 aa  89.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  26.92 
 
 		 256 aa  87.8  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  27.15 
 
 		 254 aa  87.8  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  23.91 
 
 		 336 aa  87.8  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  25.99 
 
 		 262 aa  87.8  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  25.44 
 
 		 251 aa  87  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  27.8 
 
 		 255 aa  86.7  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  31.33 
 
 		 254 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  30.36 
 
 		 252 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  28.28 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  23.4 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  23.84 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  23.84 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  23.84 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  24.73 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  23.84 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  23.84 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  23.78 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  25.17 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  27.18 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  29.78 
 
 		 251 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0113  AP endonuclease  30.34 
 
 		 267 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  25.07 
 
 		 285 aa  79.7  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  25.78 
 
 		 257 aa  79  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  29.17 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  23.36 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  30.46 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  25.77 
 
 		 253 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  28.57 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  23.13 
 
 		 252 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  29.17 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  23.86 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  28.57 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  24.47 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  23.51 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  30.99 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  24.38 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  26.1 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  26.53 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  25.43 
 
 		 258 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  27.08 
 
 		 260 aa  76.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  24.45 
 
 		 255 aa  76.3  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  24.83 
 
 		 257 aa  76.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  31.1 
 
 		 249 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  25.69 
 
 		 261 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  25.69 
 
 		 261 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  29.07 
 
 		 254 aa  75.5  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  28.66 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02934  exodeoxyribonuclease III  27.43 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  24.75 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  25.09 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  27.38 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  24.83 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  23.51 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28 
 
 		 259 aa  73.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0295  exodeoxyribonuclease III Xth  26.14 
 
 		 266 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  25.45 
 
 		 253 aa  72.8  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  27.71 
 
 		 255 aa  73.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0157  exodeoxyribonuclease III Xth  29.32 
 
 		 258 aa  72.4  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00989742  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  30.51 
 
 		 261 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0459  exodeoxyribonuclease III Xth  29.61 
 
 		 265 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  27.78 
 
 		 249 aa  72  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  28.82 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  25.63 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  26.19 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2513  exodeoxyribonuclease III Xth  24.19 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  25.54 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  24.83 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  27.78 
 
 		 259 aa  70.1  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  24.09 
 
 		 259 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  25.98 
 
 		 259 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  27.78 
 
 		 259 aa  70.1  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4139  exodeoxyribonuclease III Xth  25.37 
 
 		 248 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000428819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  25.08 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  29.59 
 
 		 256 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  24.74 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  29.71 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  27.78 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  27.78 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0431  exodeoxyribonuclease III  30.36 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0460  exodeoxyribonuclease III Xth  29.76 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  30.18 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  30.18 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  30.18 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>