More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00900 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI00900  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+), putative  100 
 
 
500 aa  1028    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.825171  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03829  succinate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  54.24 
 
 
531 aa  546  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.75 
 
 
480 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.57 
 
 
503 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.55 
 
 
480 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.58 
 
 
489 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.55 
 
 
480 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.58 
 
 
489 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.16 
 
 
503 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.58 
 
 
489 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.37 
 
 
489 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.23 
 
 
482 aa  530  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.17 
 
 
489 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.02 
 
 
482 aa  530  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.37 
 
 
489 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.34 
 
 
480 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.37 
 
 
489 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  53.81 
 
 
482 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.98 
 
 
483 aa  528  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.61 
 
 
482 aa  525  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_006686  CND01570  succinate-semialdehyde dehydrogenase, putative  52.11 
 
 
561 aa  526  1e-148  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0842141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.81 
 
 
482 aa  528  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.81 
 
 
482 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.17 
 
 
488 aa  526  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  53.81 
 
 
482 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.4 
 
 
482 aa  524  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.98 
 
 
483 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.77 
 
 
483 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.05 
 
 
479 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.34 
 
 
489 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.26 
 
 
493 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.37 
 
 
482 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.72 
 
 
489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.51 
 
 
489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.72 
 
 
489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.37 
 
 
482 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.39 
 
 
483 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.16 
 
 
482 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.37 
 
 
482 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  53.72 
 
 
489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.72 
 
 
489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.58 
 
 
488 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.72 
 
 
489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.95 
 
 
486 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.27 
 
 
480 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.51 
 
 
482 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.58 
 
 
480 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.31 
 
 
482 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.51 
 
 
482 aa  512  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.57 
 
 
493 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.8 
 
 
483 aa  514  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.31 
 
 
482 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.37 
 
 
482 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.86 
 
 
480 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.51 
 
 
500 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.57 
 
 
484 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5862  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.59 
 
 
485 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211994  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.31 
 
 
482 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.27 
 
 
482 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.8 
 
 
489 aa  507  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.43 
 
 
490 aa  506  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.35 
 
 
479 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.33 
 
 
484 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.13 
 
 
486 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  53.22 
 
 
491 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.1 
 
 
500 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.43 
 
 
485 aa  501  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.47 
 
 
483 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.35 
 
 
479 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.03 
 
 
492 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.1 
 
 
500 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.61 
 
 
482 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.82 
 
 
492 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0149  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.49 
 
 
485 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.09 
 
 
484 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.94 
 
 
481 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.16 
 
 
493 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.02 
 
 
485 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.02 
 
 
482 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
486 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.61 
 
 
482 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0257  succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.19 
 
 
485 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.33 
 
 
488 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.53 
 
 
484 aa  495  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  52.69 
 
 
480 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.03 
 
 
486 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.03 
 
 
486 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
496 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.81 
 
 
482 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.42 
 
 
480 aa  498  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1012  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.43 
 
 
511 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.34 
 
 
484 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.23 
 
 
492 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.13 
 
 
484 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.28 
 
 
483 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.61 
 
 
509 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2257  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.17 
 
 
490 aa  490  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.142739  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.64 
 
 
486 aa  491  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.9 
 
 
483 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
492 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>