More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0624 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  228  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  97.54 
 
 
122 aa  223  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 
122 aa  153  7e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  55 
 
 
128 aa  107  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  49.17 
 
 
124 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  49.17 
 
 
124 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  49.17 
 
 
124 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  49.17 
 
 
124 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  49.17 
 
 
124 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  48.33 
 
 
124 aa  103  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  48.33 
 
 
124 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  48.33 
 
 
124 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 
124 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 
124 aa  94.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  47.41 
 
 
127 aa  93.6  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 
124 aa  92  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  49.15 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  46.55 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  45.45 
 
 
130 aa  88.2  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  46.97 
 
 
128 aa  87.8  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1007  CrcB protein  44.07 
 
 
126 aa  84.7  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.83695  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  46.49 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 
124 aa  84  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 
123 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  44 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  45.69 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  41.84 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  42.4 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  36.51 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 
126 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  43.3 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  41.18 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  48.45 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  46.34 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  43.52 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  37.8 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  38 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  42 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  39.67 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  38.26 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  39 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  39.02 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  45.92 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  36.36 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  43.93 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  39.52 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  39.52 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  41.18 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  36.97 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  39.52 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  44.55 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  38.98 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  41.18 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  39.81 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  40.91 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  40.91 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  41.74 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  41.88 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  37.19 
 
 
121 aa  67  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  33.88 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0037  CrcB protein  37.82 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000769905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  32.23 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  32.48 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  36.44 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  38.26 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  39.25 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>