72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1611 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1611  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 339 aa  681    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0794  SpoOJ regulator  47.51 
 
 		 341 aa  321  9.000000000000001e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1744  TPR repeat-containing protein  48.68 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2067  TPR repeat-containing protein  49.56 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.885223  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1977  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1496  hypothetical protein  38.18 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1809  hypothetical protein  39.22 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1628  hypothetical protein  39.22 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0502575  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1997  hypothetical protein  38.62 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2026  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 348 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  26.98 
 
 		 389 aa  72  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1533  tetratricopeptide repeat protein  27.04 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0644  tetratricopeptide repeat protein  27.04 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0158  tetratricopeptide repeat protein  27.27 
 
 		 400 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.185124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0934  tetratricopeptide repeat protein  22.01 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1537  tetratricopeptide repeat protein  33.71 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1594  tetratricopeptide repeat protein  33.71 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.632242  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00894  tetratricopeptide repeat protein  31.82 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0775107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1649  tetratricopeptide repeat protein  32.58 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.165991  normal  0.0903087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3032  tetratricopeptide repeat protein  28.68 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1546  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 397 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1502  tetratricopeptide repeat protein  24.58 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018122  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 		 870 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1378  tetratricopeptide repeat protein  29.2 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1374  tetratricopeptide repeat protein  29.2 
 
 		 389 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02118  tetratricopeptide repeat protein  31.78 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000128021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0552  photosystem I assembly protein Ycf3  33.01 
 
 		 173 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1957  tetratricopeptide repeat protein  29 
 
 		 386 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000379744  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3372  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 4095 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3891  photosystem I assembly protein Ycf3  30 
 
 		 196 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2464  tetratricopeptide repeat protein  30.7 
 
 		 389 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000301038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1027  hypothetical protein  29.91 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000719629  unclonable  0.0000000000401052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0906  hypothetical protein  29.91 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.330727  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2073  tetratricopeptide repeat protein  26 
 
 		 386 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000729266  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 		 264 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02857  tetratricopeptide repeat protein  23.64 
 
 		 391 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2215  photosystem I assembly protein Ycf3  34.78 
 
 		 173 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.167684 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2393  tetratricopeptide repeat protein  26 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2069  tetratricopeptide repeat protein  26 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265574  unclonable  0.00000000000285968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0725  tetratricopeptide repeat protein  33.33 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0176529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1927  tetratricopeptide repeat protein  27 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000214151  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2276  tetratricopeptide repeat protein  26 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000164995  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  32.69 
 
 		 1676 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  33.72 
 
 		 837 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1180 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1216  tetratricopeptide repeat protein  32.97 
 
 		 408 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608666  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3010  tetratricopeptide repeat protein  29.51 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00816471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1739  tetratricopeptide repeat protein  27.1 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000105333  hitchhiker  0.00275334 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2399  tetratricopeptide repeat protein  27.27 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1980  tetratricopeptide repeat protein  27 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000007627  unclonable  0.0000000000727651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3996  photosystem I assembly protein Ycf3  30.63 
 
 		 173 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00079078 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2852  tetratricopeptide TPR_2  30.49 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2153  photosystem I assembly protein Ycf3  32.86 
 
 		 173 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  24.81 
 
 		 929 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  26.53 
 
 		 577 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2051  tetratricopeptide repeat protein  27 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000458235  unclonable  0.0000309501 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  26.53 
 
 		 577 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4206  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 173 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.838663  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2076  tetratricopeptide repeat protein  24.7 
 
 		 386 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2314  tetratricopeptide repeat protein  27.88 
 
 		 386 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000283744  hitchhiker  0.000000379293 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  24.64 
 
 		 992 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1937  hypothetical protein  39.66 
 
 		 394 aa  43.5  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314612  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 579 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2566  tetratricopeptide repeat protein  34.74 
 
 		 407 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2120  tetratricopeptide repeat protein  30 
 
 		 386 aa  43.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000410522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2384  N-acetylglucosaminyl transferase-like protein  27.68 
 
 		 539 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2039  tetratricopeptide repeat protein  26 
 
 		 386 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0782  tetratricopeptide repeat protein  30.77 
 
 		 424 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0709697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.37 
 
 		 565 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2254  tetratricopeptide repeat protein  27.21 
 
 		 390 aa  42.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3221  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 392 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0588004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>