117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1607 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1607  putative ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II  100 
 
 
299 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3383  glycosyl transferase family 9  39.74 
 
 
313 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2881  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like  22.87 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275572 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3797  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.82 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.25 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  20.38 
 
 
334 aa  63.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.01 
 
 
362 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.99 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20 
 
 
359 aa  59.7  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  22.51 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.47 
 
 
359 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  24.93 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.7 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  19.77 
 
 
345 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2512  glycosyl transferase family 9  30.85 
 
 
335 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.122114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  29.79 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
351 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.93 
 
 
353 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.61 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  20.68 
 
 
354 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  23.81 
 
 
344 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  28.72 
 
 
779 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.29 
 
 
361 aa  53.1  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  22.02 
 
 
337 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  19.17 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0391  glycosyl transferase family 9  21.72 
 
 
359 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0900723  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  25.2 
 
 
388 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  20.65 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.71 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  24.6 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.56 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0393  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
385 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326109  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  22.86 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  20.68 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.26 
 
 
356 aa  50.8  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  19.25 
 
 
363 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.32 
 
 
361 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1283  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.8 
 
 
316 aa  50.4  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0326362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  27.27 
 
 
341 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 
324 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  24.12 
 
 
356 aa  49.7  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1226  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.03 
 
 
304 aa  50.1  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.56987e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0470  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.74 
 
 
324 aa  49.3  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0284268  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0580  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.19 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.604166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0479  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.93 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  28.07 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  28.07 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  29.03 
 
 
335 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0768  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.9 
 
 
346 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
369 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.81 
 
 
367 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  27.08 
 
 
352 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.21 
 
 
352 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  19.16 
 
 
368 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.96 
 
 
346 aa  46.2  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1237  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.79 
 
 
314 aa  46.2  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  20.13 
 
 
367 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.61 
 
 
356 aa  45.8  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  31.18 
 
 
781 aa  45.8  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  21.09 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1612  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  33.85 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1399  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.49 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.348076  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.81 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1805  glycosyl transferase family 9  27.68 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.69 
 
 
352 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3991  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  41.86 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4036  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  41.86 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3910  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  41.86 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3929  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  41.86 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4097  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  41.86 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.37 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25 
 
 
350 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1228  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.82 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3770  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.67 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242011  normal  0.536434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4509  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.89 
 
 
358 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.92 
 
 
352 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.74 
 
 
341 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.92 
 
 
352 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.84 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.84 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  19.93 
 
 
329 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  19.81 
 
 
360 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3802  glycosyl transferase family protein  20.83 
 
 
403 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2239  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
431 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0789  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.83 
 
 
335 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4370  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  37.21 
 
 
355 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  18.36 
 
 
346 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.88 
 
 
354 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  37.21 
 
 
349 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  24.21 
 
 
356 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  24.21 
 
 
356 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  37.21 
 
 
354 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  22.02 
 
 
352 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  37.21 
 
 
354 aa  43.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  37.21 
 
 
354 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  20.54 
 
 
334 aa  43.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  23.16 
 
 
574 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.51 
 
 
358 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4826  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  39.53 
 
 
348 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290967  hitchhiker  0.000199841 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>