45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0344 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  78.51 
 
 
498 aa  795    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  100 
 
 
497 aa  1027    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  51.54 
 
 
520 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  51.54 
 
 
520 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  51.54 
 
 
520 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  51.33 
 
 
520 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  51.33 
 
 
520 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  41.01 
 
 
485 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  33.67 
 
 
483 aa  246  4.9999999999999997e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  32.42 
 
 
473 aa  245  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  32.61 
 
 
474 aa  243  5e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  34.97 
 
 
477 aa  242  1e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  32.92 
 
 
482 aa  238  2e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  35.95 
 
 
478 aa  236  9e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  32.29 
 
 
467 aa  234  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  34.67 
 
 
471 aa  224  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  32.51 
 
 
458 aa  219  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  31.24 
 
 
474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  31.62 
 
 
476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  31.12 
 
 
535 aa  213  5.999999999999999e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  31.74 
 
 
533 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  31.8 
 
 
477 aa  209  9e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  31.55 
 
 
465 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  28.27 
 
 
507 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  29.7 
 
 
529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  30.92 
 
 
471 aa  182  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  30.09 
 
 
544 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  25 
 
 
639 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  25.9 
 
 
750 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  24.67 
 
 
552 aa  130  8.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  24.4 
 
 
593 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  25.99 
 
 
548 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  25.57 
 
 
549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  25.57 
 
 
548 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  23.47 
 
 
605 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  22.24 
 
 
562 aa  94  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  20.89 
 
 
562 aa  91.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  23.73 
 
 
586 aa  85.9  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  22.59 
 
 
561 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  23.35 
 
 
509 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  22.47 
 
 
549 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  27.75 
 
 
630 aa  53.5  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0390  peptidase U34, dipeptidase  25.68 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.17087  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  22.46 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0527  peptidase U34, dipeptidase  19.56 
 
 
415 aa  43.5  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>