More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0526 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0526  GTP-binding protein  100 
 
 
291 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.45 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0694  NAD dependent epimerase/dehydratase family  26.67 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  24.03 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.92 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  26.54 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.61 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.49 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
326 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.34 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.15 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  23.79 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.49 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 
325 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.05 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.37 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.48 
 
 
336 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.05 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
332 aa  63.9  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
336 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
326 aa  63.5  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.3 
 
 
313 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 
359 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 
302 aa  63.5  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107355  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.44 
 
 
329 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.13 
 
 
312 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.44 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.86 
 
 
323 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.3 
 
 
310 aa  62.4  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
324 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  24.9 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13665  UDP-glucose 4-epimerase galE1  24.61 
 
 
314 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0159869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.87 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0670  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125394  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.48 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.92 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.2 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2505  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.24 
 
 
338 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000697027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.13 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2107  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.24 
 
 
338 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.937319  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1237  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.11 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000110601  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556189  normal  0.226818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
338 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  28.24 
 
 
321 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33900  UDP-glucose 4-epimerase  22.87 
 
 
313 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.18 
 
 
342 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
331 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.24 
 
 
321 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  28.24 
 
 
321 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.24 
 
 
321 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.24 
 
 
321 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
334 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 
308 aa  60.1  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.24 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 
342 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
324 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.24 
 
 
321 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.68 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.24 
 
 
321 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
292 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.17 
 
 
328 aa  59.3  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.28 
 
 
321 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.26 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 
316 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325743  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 
329 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.28 
 
 
321 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.13 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.45 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
284 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 
308 aa  58.9  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0169  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  25.74 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
325 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
304 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>