More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04260 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04260  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  396  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  39.36 
 
 		 183 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  34.22 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  40.97 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  40.97 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  40.97 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  38.36 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  41.78 
 
 		 235 aa  92  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  40.97 
 
 		 186 aa  91.3  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  40.14 
 
 		 186 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  40.14 
 
 		 185 aa  91.3  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  40.14 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  40.14 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  40.14 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  40.14 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  40.14 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  40.85 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  40.14 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  40.97 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  42.25 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  40.14 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  40.97 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  40.14 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  39.58 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  39.58 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  35.47 
 
 		 200 aa  88.2  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  42.25 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  40.14 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  39.44 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  36.49 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  40.28 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  39.19 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  34.16 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  40.69 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  37.67 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  35.92 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  37.41 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  37.59 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  30.65 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  38.35 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  36.91 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  39.84 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0050  DNA-invertase from lambdoid prophage Qin  30.65 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112897  hitchhiker  0.000566383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  30.93 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  30.93 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  43.88 
 
 		 154 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  32.88 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  29.47 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  32.64 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  45.83 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  30.77 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  38.03 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  30.41 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  38.03 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  33.96 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  32.88 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  31.44 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  32.65 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  30.93 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  45.88 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  32.88 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  34.23 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  34.23 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  33.16 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  36.6 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  31.51 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  34.29 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  32.67 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  33.78 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  32.08 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  45.88 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2549  Resolvase domain protein  35.03 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0121219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  30.41 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  32.08 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  33.78 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  33.78 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  33.78 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  33.77 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  37.21 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  36.13 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  31.05 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  36.73 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  32.52 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  30.96 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  34.93 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  33.12 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  34.2 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  32.64 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  30.96 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  30.96 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  30.96 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  30.96 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  32.41 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>