More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02665 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02665  single-strand DNA-binding protein  100 
 
 		 161 aa  337  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1538  single-strand binding protein  63.64 
 
 		 146 aa  187  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545074  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0979  single-strand binding protein  60.17 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  42.53 
 
 		 177 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  44.24 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  44.17 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  44.53 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  42.51 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  36.65 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  42.69 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  43.71 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  41.07 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  36.42 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0796  single-strand binding protein  42.94 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000662422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  40.72 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  40.24 
 
 		 149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1425  single-strand binding protein  50.47 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.195653  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  38.51 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  38.51 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  41.61 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2198  single-strand binding protein  36.42 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00537344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  38.42 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2988  single-strand binding protein  51.96 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0391895 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  36.84 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1236  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  49.53 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  49.53 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  35.09 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3806  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2848  single-strand binding protein  48.08 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.89958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  35.75 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  37.35 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  43.03 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  36.05 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1927  single-stranded DNA-binding protein  39.05 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  49.48 
 
 		 180 aa  110  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0451  single-strand binding protein  35.58 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0123838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2452  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  38.29 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2879  single-strand binding protein  37.13 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.561804  normal  0.0379705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2079  single-stranded DNA-binding protein  36.81 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  42.02 
 
 		 178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1606  single stranded DNA-binding protein  44.92 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.597102  normal  0.594419 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  44.76 
 
 		 230 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0439  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 173 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  33.52 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  33.52 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  34.81 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  33.52 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  49.53 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  37.2 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  33.52 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1793  single-strand DNA binding protein  45.79 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.147298  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  33.52 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  33.52 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  36.84 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  38.51 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  41.98 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  33.52 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  36.14 
 
 		 167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  33.52 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1816  single-strand binding protein  40.94 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0697852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  36.88 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  47.71 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1742  single-stranded DNA-binding protein  41.07 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.366869 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  47.52 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4373  single-stranded DNA-binding protein  37.35 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3154  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 167 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  43.12 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  37.95 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  39.67 
 
 		 222 aa  107  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  42.03 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4185  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  45.1 
 
 		 178 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  34.09 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  50.51 
 
 		 147 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  37.11 
 
 		 148 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1885  single-strand binding protein  47.06 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110656  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4448  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0398944  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2713  single-stranded DNA-binding protein  34.73 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  46.3 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  31.52 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3737  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 186 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0280171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  36.71 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  46.79 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  35.09 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  34.81 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  36.65 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  45.36 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  34.62 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  34.62 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  35.98 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>