114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4298 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4298  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1673  hypothetical protein  61.09 
 
 		 221 aa  282  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0840  hypothetical protein  53.64 
 
 		 219 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4419  hypothetical protein  56.62 
 
 		 219 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3753  hypothetical protein  54.79 
 
 		 217 aa  254  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000391116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3382  hypothetical protein  51.58 
 
 		 220 aa  236  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704087  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3332  hypothetical protein  50.23 
 
 		 224 aa  234  8e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3105  hypothetical protein  47.73 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000234851  normal  0.527645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0772  hypothetical protein  45.7 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.252597  normal  0.28705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5729  hypothetical protein  44.09 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86097  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0154  hypothetical protein  42.4 
 
 		 215 aa  192  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0660485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4143  hypothetical protein  43.69 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.409025  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25100  hypothetical protein  43.24 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1961  hypothetical protein  36.12 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0400694 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02805  hypothetical protein  27.35 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.541776  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03421  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00670)  28.65 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620019  normal  0.0597509 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1648  hypothetical protein  32.16 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0855  hypothetical protein  29.52 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3938  hypothetical protein  32.03 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3209  hypothetical protein  28.24 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.165014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2917  Male sterility-like  34.21 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.958914  normal  0.0966532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03370  NAD-binding domain 4, putative  32.26 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00577736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6648  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  28.39 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0740  hypothetical protein  29.63 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2271  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  31.41 
 
 		 222 aa  62  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3634  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.88 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00120492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03019  predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.53 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41353  predicted protein  29.41 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3447  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.98 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4471  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.98 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02970  hypothetical protein  31.53 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0605  hypothetical protein  33.68 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1996  hypothetical protein  33.68 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2918  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.94 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18779  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0697  hypothetical protein  33.68 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3620  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.53 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3344  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.08 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2067  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615867  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01753  Protein fmp52, mitochondrial Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCH7]  28.93 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1220  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.28 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2105  hypothetical protein  28.1 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1890  hypothetical protein  28.1 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1852  oxidoreductase  28.1 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1842  oxidoreductase  28.1 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.348398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2037  hypothetical protein  28.1 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0766  Male sterility-like  33.55 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1247  hypothetical protein  33.55 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.627598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2138  hypothetical protein  28.1 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2027  hypothetical protein  28.76 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3282  hypothetical protein  28.39 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2069  hypothetical protein  28.1 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08634  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07320)  25.97 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1968  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00928979  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11890  hypothetical protein  26.22 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.35 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2265  hypothetical protein  27.2 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.908701  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4377  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  32.9 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0624  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.32 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1092  hypothetical protein  26.22 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0686  hypothetical protein  32.05 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.74 
 
 		 297 aa  52.4  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2944  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.43 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.12 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3890  hypothetical protein  33.73 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3526  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.26 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3563  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.26 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3457  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.26 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3455  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.26 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3623  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.26 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02123  hypothetical protein  25.58 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.659696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1127  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  33.55 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57883  predicted protein  29.52 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0900155  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1639  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  26.88 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243348  normal  0.0401648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1130  NADH dehydrogenase  26.97 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543153  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3118  NmrA family protein  40 
 
 		 289 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1774  semialdehyde dehydrogenase  27.23 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1486  oxidoreductase  26.47 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175659  normal  0.304876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2168  hypothetical protein  29.67 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0511  hypothetical protein  30.14 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003694  NAD(P)-binding protein  26.11 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 		 357 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0031  hypothetical protein  27.31 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46234  predicted protein  24.52 
 
 		 226 aa  45.4  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4984  hypothetical protein  28.32 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0732  hypothetical protein  27.56 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387844  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1666  putative oxidoreductase  25.7 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.103837  normal  0.0874109 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1438  hypothetical protein  54.55 
 
 		 55 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>