More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3549 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3549  HOMODA hydrolase (CmtE)  100 
 
 		 301 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  83.62 
 
 		 288 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 288 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 288 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 		 316 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  33.55 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  28.94 
 
 		 291 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 		 295 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  26.58 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  26.78 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.75 
 
 		 276 aa  85.9  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.52 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  28.57 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.04 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  28.57 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.38 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.83 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.99 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.09 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  33.63 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  33.63 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  30.11 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.65 
 
 		 372 aa  68.9  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  38.39 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.55 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.09 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  27.09 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  29.47 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.09 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  33.63 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.09 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  33.63 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  33.63 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  32.26 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  34.51 
 
 		 261 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  27.1 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  22.14 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.37 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>