51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2571 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2571  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  201  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163005  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  60.29 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  52.38 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  53.03 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  47.69 
 
 
137 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  51.52 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  51.67 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  50 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  46.97 
 
 
238 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  46.97 
 
 
248 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  46.97 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  46.97 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  46.97 
 
 
177 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  46.97 
 
 
177 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  46.97 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  46.97 
 
 
177 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  46.97 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  49.18 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  46.97 
 
 
374 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  43.94 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  46.77 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  42.42 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  48.28 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  46.55 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  50.94 
 
 
169 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  48.08 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 
154 aa  50.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  48.08 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 
213 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  48.08 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  45.16 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  47.27 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  45.9 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  41.27 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  33.82 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  44.26 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  48.94 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  43.64 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  43.64 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  43.48 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  39.68 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  45.28 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  41.3 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
152 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  43.48 
 
 
124 aa  40.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  35.29 
 
 
146 aa  40  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  40.32 
 
 
163 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>