32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1326 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1326  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  797    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0539  hypothetical protein  49.39 
 
 		 419 aa  338  8e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  49.88 
 
 		 416 aa  329  5.0000000000000004e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  50.13 
 
 		 403 aa  329  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  48.93 
 
 		 416 aa  322  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0759  hypothetical protein  47.85 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.777484  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0670  general secretion pathway L  48.29 
 
 		 409 aa  302  9e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.216187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0649  General secretion pathway L  48.05 
 
 		 409 aa  301  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.01067  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  43.71 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  36.41 
 
 		 428 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  38.12 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  29.86 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  32.9 
 
 		 457 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  32.94 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  32.94 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  33.12 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  32.69 
 
 		 475 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  33.33 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  37.5 
 
 		 466 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  34.68 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  35.48 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  33.78 
 
 		 469 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  33.78 
 
 		 469 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  33.78 
 
 		 469 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  33.78 
 
 		 469 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  33.78 
 
 		 469 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  33.78 
 
 		 462 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  33.78 
 
 		 462 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  32.43 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  33.03 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  29.06 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3177  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.633159  normal  0.0234949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>