175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2778 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2778  protein of unknown function DUF159  100 
 
 		 240 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1349  hypothetical protein  87.92 
 
 		 240 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1711  hypothetical protein  38.49 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2763  hypothetical protein  36.73 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0250851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  37.4 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  38.21 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  35.92 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  35.43 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  36.84 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  36.84 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  36.84 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  36.48 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  36.48 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  36.48 
 
 		 223 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2433  hypothetical protein  34.85 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3296  hypothetical protein  33.47 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2834  hypothetical protein  33.06 
 
 		 229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263955  normal  0.106264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2941  hypothetical protein  33.75 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433222  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  33.74 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2746  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1095  hypothetical protein  40.91 
 
 		 208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1129  hypothetical protein  40.91 
 
 		 208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0734  hypothetical protein  37.97 
 
 		 147 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  32.38 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  34.13 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  28.74 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  29.17 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  29.89 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  30.74 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  27.69 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  30.33 
 
 		 222 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  28.68 
 
 		 281 aa  86.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  27.5 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  27.08 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  32.09 
 
 		 191 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  31.69 
 
 		 257 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  27.53 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  26.83 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  27.57 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  26.88 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  30.27 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  26.91 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  30.39 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  25.7 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  28.74 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  29.92 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  27.05 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  28.4 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  27.98 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  29.95 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  26.94 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  27.24 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  26.51 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3704  protein of unknown function DUF159  25.82 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  27.23 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  28.71 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  26.64 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  28.91 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  27.7 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  30.1 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  29.05 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  26.64 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  28.4 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  26.34 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  27.06 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  29.28 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  25.73 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  26.56 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  25.63 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  30.43 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  29.44 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  26.64 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2031  hypothetical protein  31.32 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  27.95 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  26.56 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  26.85 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  24.08 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  27.72 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2605  hypothetical protein  27.13 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  24.48 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  24.48 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  27.48 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  25.21 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2115  protein of unknown function DUF159  27.18 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  24.48 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  26.97 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  26.64 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  26.12 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1263  hypothetical protein  27.13 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  26.56 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  25.31 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  27.01 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  25.71 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  25.63 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  24.22 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  27.23 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  26.64 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  26.13 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>