More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7238 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7238  response regulator receiver protein  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24892  normal  0.77163 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5170  response regulator receiver protein  51.21 
 
 		 225 aa  190  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916187 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 		 1631 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2881  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000073998  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6598  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.165096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  34.48 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.97 
 
 		 242 aa  77.8  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  34.78 
 
 		 121 aa  77  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 121 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 1651 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 121 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 121 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2580  response regulator receiver domain-containing protein  42.73 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 		 1646 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  34.29 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.97 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.6 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 		 230 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  35.04 
 
 		 458 aa  74.3  0.0000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.82 
 
 		 227 aa  74.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 223 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 223 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.54 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  35.29 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  37.04 
 
 		 1347 aa  73.9  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  35.65 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3956  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  35.48 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  34.81 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  35.04 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  36.03 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  34.75 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  35.65 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  36.04 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.95 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1726  hypothetical protein  33.08 
 
 		 437 aa  72  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1726  hypothetical protein  33.08 
 
 		 437 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 122 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1367  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.9 
 
 		 905 aa  72  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0722784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 468 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428008  normal  0.0222917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 121 aa  72  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  35.54 
 
 		 120 aa  72  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0246  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.94 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0272164  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01810  transcriptional regulatory protein  31.91 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1343  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  32.82 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  30.86 
 
 		 248 aa  71.2  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.94 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  32.82 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  33.91 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  34.27 
 
 		 255 aa  71.2  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  33.91 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2813  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 274 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  34.07 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  32.82 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  32.82 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  32.82 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.11 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  36.51 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 1002 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2294  two component transcriptional regulator  33.09 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000876575  normal  0.575243 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  32.82 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  32.06 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  32.82 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 120 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  32.87 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4785  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.692787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>