More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6670 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  72.62 
 
 		 517 aa  750    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2055  AMP-dependent synthetase and ligase  72.27 
 
 		 472 aa  679    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5887  AMP-dependent synthetase and ligase  75.2 
 
 		 517 aa  773    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0385595  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6670  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 530 aa  1092    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2182  AMP-dependent synthetase and ligase  83.11 
 
 		 525 aa  897    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2076  long-chain-fatty acid CoA ligase  82.96 
 
 		 525 aa  897    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4726  AMP-dependent synthetase and ligase  64.09 
 
 		 519 aa  619  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.670318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  64.26 
 
 		 516 aa  615  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  64.64 
 
 		 513 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0851  AMP-dependent synthetase and ligase  61.37 
 
 		 517 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.422198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0671  AMP-dependent synthetase and ligase  61.34 
 
 		 517 aa  609  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251823  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3722  AMP-dependent synthetase and ligase  59.6 
 
 		 511 aa  607  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  54.69 
 
 		 522 aa  547  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.97 
 
 		 524 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 		 520 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.15 
 
 		 519 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.98 
 
 		 518 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 		 518 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.29 
 
 		 518 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.97 
 
 		 518 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.6 
 
 		 518 aa  266  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.62 
 
 		 518 aa  263  8e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.87 
 
 		 518 aa  259  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.92 
 
 		 518 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 530 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.87 
 
 		 518 aa  258  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2250  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 		 538 aa  257  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0832  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.73 
 
 		 518 aa  257  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0876  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.73 
 
 		 518 aa  257  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 525 aa  233  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 521 aa  229  7e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.96 
 
 		 513 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.63 
 
 		 503 aa  229  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 520 aa  220  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  33.14 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 509 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  31.04 
 
 		 517 aa  217  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  30.83 
 
 		 503 aa  216  8e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 515 aa  213  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 		 502 aa  212  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.9 
 
 		 517 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.9 
 
 		 517 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.9 
 
 		 517 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 524 aa  212  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 521 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.75 
 
 		 492 aa  211  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 506 aa  210  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.58 
 
 		 481 aa  209  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 532 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 542 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 518 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 515 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 		 515 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 511 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.68 
 
 		 526 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 508 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 1043 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.06 
 
 		 481 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5576  acyl-CoA synthetase  32.8 
 
 		 519 aa  207  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.18 
 
 		 481 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.38 
 
 		 482 aa  206  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3772  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  31.99 
 
 		 531 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.910601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 		 509 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 		 499 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 		 516 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.94 
 
 		 482 aa  204  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 518 aa  203  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  31.18 
 
 		 514 aa  203  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 532 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  32.53 
 
 		 516 aa  203  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 		 512 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 518 aa  202  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.08 
 
 		 482 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  30.98 
 
 		 513 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 518 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.08 
 
 		 482 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  31.97 
 
 		 522 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.17 
 
 		 525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.01 
 
 		 490 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 		 523 aa  200  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.34 
 
 		 482 aa  200  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.88 
 
 		 481 aa  200  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 507 aa  200  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.88 
 
 		 482 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  32.28 
 
 		 564 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 518 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  30.68 
 
 		 517 aa  199  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 535 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.21 
 
 		 497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  28.18 
 
 		 500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  28.63 
 
 		 488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.55 
 
 		 527 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  29.33 
 
 		 500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  28.54 
 
 		 500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  29.65 
 
 		 533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>