More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4655 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4655  ribokinase  100 
 
 		 319 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.557505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  83.17 
 
 		 328 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1401  ribokinase  83.28 
 
 		 325 aa  447  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.033164  normal  0.166986 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1272  putative ribokinase  81.7 
 
 		 320 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0725613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  57.57 
 
 		 310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  56.62 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  58.8 
 
 		 305 aa  332  5e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  55.3 
 
 		 307 aa  329  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7825  putative ribokinase  63.02 
 
 		 310 aa  322  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  51.94 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  44.37 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  47.7 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  46.67 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  46 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  44.82 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  43.33 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  38.64 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  38.61 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  38.61 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  38.61 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  38.61 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  38.61 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  46 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  46 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  39.26 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  36.3 
 
 		 310 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  45.67 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  36.63 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  44.52 
 
 		 310 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  42 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  38.13 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  43.18 
 
 		 308 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  38.96 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  41.72 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  43.18 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  36.42 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  41.67 
 
 		 302 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  37.58 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  38.36 
 
 		 308 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  38.36 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  38.36 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  36.69 
 
 		 424 aa  192  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  41.72 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  38.19 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  43.46 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  43.23 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  47.44 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  40.72 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  40.72 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  40.72 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  40.72 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  44.7 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  42.61 
 
 		 295 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  43.75 
 
 		 309 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  39.53 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  38.16 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  41.28 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  40.39 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  43.52 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  42.67 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  39.87 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  36.51 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  35.35 
 
 		 404 aa  185  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  45.98 
 
 		 309 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  39.87 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  39.87 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  39.87 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  39.87 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  39.87 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  39.87 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  39.87 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  37.42 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  39.54 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  40.61 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  37.12 
 
 		 307 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  40.47 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  36.21 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  37.91 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  36.75 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  36.75 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  46.37 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  36.75 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  42.38 
 
 		 305 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  37.66 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  33.44 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  41.97 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  41.69 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  36.09 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  36.88 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  36.88 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  38.16 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  38.69 
 
 		 309 aa  179  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  34.58 
 
 		 404 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  37.38 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2205  PfkB  41.45 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  34.58 
 
 		 404 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  34.58 
 
 		 404 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  38.51 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  33 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  35.37 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>