More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0557 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
336 aa  659    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.654938  hitchhiker  0.00239439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.61 
 
 
336 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000749118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0789  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, innermembrane subunit  88.16 
 
 
336 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445357  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.76 
 
 
321 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 
318 aa  252  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
319 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
313 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.14 
 
 
329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0433381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.42 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  39.42 
 
 
305 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
317 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
317 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11732  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
317 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
317 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367401  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
317 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189193  normal  0.0388452 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
318 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
315 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
314 aa  202  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3714  nickel ABC transporter permease(nikB)  37.05 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.744523 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3654  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.66 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24114  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1496  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.41 
 
 
317 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0592571  hitchhiker  0.00104158 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0787  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  36.1 
 
 
317 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.63 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  36.63 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.63 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.63 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.63 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
322 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
322 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
322 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.63 
 
 
306 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5663  ABC transporter membrane spanning protein  34.08 
 
 
318 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16220  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.92 
 
 
318 aa  192  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270371  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
316 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.33692 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
316 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551885 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.3 
 
 
306 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
316 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
313 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
317 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.0574372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
305 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.507532  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
316 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.570191  normal  0.169203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
313 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0546452  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
304 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 
305 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
316 aa  189  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  35.64 
 
 
306 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 
306 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  35.64 
 
 
306 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1923  ABC transporter permease  33.87 
 
 
316 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887437  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  35.64 
 
 
306 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  35.64 
 
 
306 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
306 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
314 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.965219  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
313 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1114  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  36.16 
 
 
327 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35.13 
 
 
306 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0156  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.41 
 
 
318 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383247  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
306 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
305 aa  185  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
318 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.054126  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.725204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01740  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.86 
 
 
334 aa  183  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
313 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
306 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
306 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221048  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
306 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  34.43 
 
 
306 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1866  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  35.24 
 
 
306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
306 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
313 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0323  ABC transporter permease protein  35.87 
 
 
306 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1357  putative glutathione ABC transporter, permease protein  35.87 
 
 
306 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0240  putative glutathione ABC transporter, permease protein  35.87 
 
 
306 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  37.41 
 
 
306 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
319 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  37.41 
 
 
306 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 
313 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1766  putative glutathione ABC transporter, permease protein  35.87 
 
 
306 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
306 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1851  ABC transport permease  35.87 
 
 
306 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
306 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17239  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
306 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.191651  hitchhiker  0.00741174 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0400  putative glutathione ABC transporter, permease protein  35.87 
 
 
306 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>