146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0512 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0512  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  771    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204603  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3223  protein of unknown function DUF72  78.7 
 
 
489 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.873397  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0739  hypothetical protein  70.65 
 
 
422 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0715  hypothetical protein  70.09 
 
 
505 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0023847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0357  hypothetical protein  72.42 
 
 
522 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000555141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0657  hypothetical protein  72.42 
 
 
522 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2492  hypothetical protein  72.42 
 
 
522 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000876051  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0105  hypothetical protein  72.42 
 
 
522 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0559982  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1059  hypothetical protein  72.42 
 
 
519 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.51988  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2618  hypothetical protein  69.88 
 
 
440 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0899  hypothetical protein  72.42 
 
 
525 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103522  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0902  hypothetical protein  72.42 
 
 
525 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2570  hypothetical protein  70.52 
 
 
433 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2489  hypothetical protein  69.58 
 
 
440 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.457254  normal  0.59095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5902  hypothetical protein  60.44 
 
 
431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.834599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1959  hypothetical protein  70.21 
 
 
433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.479808  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2594  hypothetical protein  61.29 
 
 
433 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0726  hypothetical protein  65.21 
 
 
435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.299364 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0785  protein of unknown function DUF72  52.26 
 
 
361 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.223922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0715  protein of unknown function DUF72  51.4 
 
 
361 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.0915207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0813  hypothetical protein  49.01 
 
 
355 aa  322  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0765  hypothetical protein  55.7 
 
 
355 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.143157 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2644  hypothetical protein  47.38 
 
 
356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2789  protein of unknown function DUF72  49.69 
 
 
359 aa  292  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0971015  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1823  hypothetical protein  49.38 
 
 
382 aa  281  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.599232  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1704  hypothetical protein  47.06 
 
 
365 aa  269  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.792663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1999  protein of unknown function DUF72  47.27 
 
 
363 aa  265  8e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1869  hypothetical protein  48.36 
 
 
390 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19198  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3371  hypothetical protein  39.71 
 
 
374 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241512  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0200  protein of unknown function DUF72  40.39 
 
 
339 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1934  protein of unknown function DUF72  27 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.978403  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  28.14 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  26.63 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  25.63 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  27 
 
 
267 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  23.42 
 
 
263 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  26.63 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  25.63 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3869  hypothetical protein  23.58 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0151783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  26.88 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  26 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  24.12 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  23.62 
 
 
274 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  25.13 
 
 
268 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  27.62 
 
 
254 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  25.69 
 
 
268 aa  60.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  27.08 
 
 
309 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  28.06 
 
 
251 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  22.87 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  27.07 
 
 
259 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  28.95 
 
 
249 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  27.55 
 
 
241 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  26.77 
 
 
268 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  25.51 
 
 
290 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  26.13 
 
 
237 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  28.49 
 
 
259 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  30.89 
 
 
270 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  23.26 
 
 
251 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  25.76 
 
 
268 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  28.49 
 
 
269 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  29.65 
 
 
249 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  23.76 
 
 
236 aa  56.6  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  30 
 
 
242 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  22.9 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  26.72 
 
 
259 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  24.27 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  28.06 
 
 
242 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  25.21 
 
 
264 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  27.63 
 
 
241 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  29.49 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  27.93 
 
 
265 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  29.63 
 
 
249 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  24.42 
 
 
301 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  23 
 
 
272 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  24.75 
 
 
267 aa  53.5  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  28.06 
 
 
243 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  24.06 
 
 
247 aa  52.8  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  25.25 
 
 
242 aa  52.8  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  26.4 
 
 
243 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  26.27 
 
 
312 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  27.43 
 
 
244 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  24.08 
 
 
316 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  22.6 
 
 
261 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  26.21 
 
 
271 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  30.94 
 
 
254 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  24.37 
 
 
249 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  24.3 
 
 
305 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  23.3 
 
 
308 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  26.62 
 
 
303 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  22 
 
 
264 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  27.42 
 
 
244 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  25.79 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  29.01 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  25.58 
 
 
312 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  25.44 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  25.14 
 
 
317 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  32.1 
 
 
242 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  23.22 
 
 
305 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>