More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0509 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  344  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  96.2 
 
 
171 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  95.57 
 
 
171 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  85.8 
 
 
166 aa  288  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  83.64 
 
 
167 aa  287  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  82.93 
 
 
166 aa  287  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  82.93 
 
 
166 aa  287  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  82.93 
 
 
166 aa  287  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  82.93 
 
 
166 aa  287  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  82.93 
 
 
166 aa  287  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  82.93 
 
 
166 aa  287  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  82.42 
 
 
167 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  82.42 
 
 
167 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  82.42 
 
 
167 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  82.42 
 
 
167 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  82.42 
 
 
167 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  82.42 
 
 
167 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  82.42 
 
 
167 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  65.1 
 
 
176 aa  208  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  63.09 
 
 
175 aa  204  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  63.09 
 
 
175 aa  204  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  61.94 
 
 
159 aa  201  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  64.19 
 
 
162 aa  201  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  64.34 
 
 
158 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  62.07 
 
 
158 aa  183  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  54.43 
 
 
174 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  54.43 
 
 
174 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  53.8 
 
 
174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  53.33 
 
 
174 aa  167  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2077  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.59 
 
 
181 aa  141  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  45.22 
 
 
157 aa  137  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 
157 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
157 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  39.38 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  39.38 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  43.64 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
156 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 
165 aa  131  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  43.95 
 
 
157 aa  130  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  41.52 
 
 
171 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  38.75 
 
 
162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  40.59 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  40.59 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  40.59 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  40.59 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  41.62 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  40.59 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  41.62 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  41.62 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  40.59 
 
 
222 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  40.59 
 
 
222 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
154 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  42.38 
 
 
155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  40.72 
 
 
168 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  40.72 
 
 
168 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
177 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
152 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  43.31 
 
 
157 aa  127  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  41.04 
 
 
174 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  40.59 
 
 
218 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40.13 
 
 
152 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 
154 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  40.59 
 
 
171 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  40.46 
 
 
174 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
153 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
164 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
156 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
160 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
160 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
160 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
160 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
160 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
160 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
160 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
159 aa  123  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  42.11 
 
 
152 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  42.31 
 
 
157 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 
155 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 
155 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  41.4 
 
 
161 aa  121  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
169 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
157 aa  121  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
200 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  44.44 
 
 
189 aa  121  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
200 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
163 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
158 aa  120  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  42.11 
 
 
152 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  42.11 
 
 
152 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  42.11 
 
 
152 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6006  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>