More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2824 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2824  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  5.308580000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  51.76 
 
 		 192 aa  184  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  52.38 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  47.85 
 
 		 173 aa  176  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  48.8 
 
 		 174 aa  174  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  50.9 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  47.95 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  49.4 
 
 		 171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  49.41 
 
 		 173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 172 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  47.4 
 
 		 176 aa  171  5.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  48.21 
 
 		 171 aa  170  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  47.98 
 
 		 173 aa  170  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  48.19 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  47.73 
 
 		 178 aa  168  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  46.95 
 
 		 169 aa  168  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  47.73 
 
 		 178 aa  167  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  48 
 
 		 173 aa  167  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0190  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 		 186 aa  167  9e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.140917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  47.09 
 
 		 176 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  46.63 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  47.59 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  47.4 
 
 		 175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  48.5 
 
 		 219 aa  165  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  48.8 
 
 		 200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  46.3 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 187 aa  164  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 198 aa  164  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  46.39 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  46.39 
 
 		 173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  45.18 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  49.4 
 
 		 178 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  52.07 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  47.56 
 
 		 180 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  48.8 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  43.64 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  42.78 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  46.25 
 
 		 173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  44.74 
 
 		 154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  44.32 
 
 		 204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  46.2 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  45.03 
 
 		 173 aa  161  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  43.43 
 
 		 196 aa  160  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  50 
 
 		 173 aa  160  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 233 aa  160  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  46.41 
 
 		 173 aa  160  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  43.53 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  44.83 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  45.03 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  51.8 
 
 		 145 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  40.91 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 159 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  47.62 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  44.77 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  49.42 
 
 		 232 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  49.42 
 
 		 230 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 173 aa  157  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  46.06 
 
 		 169 aa  157  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1871  translation initiation factor IF-3  52.35 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  47.24 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  42.44 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  44.77 
 
 		 176 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  44.77 
 
 		 173 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  42.44 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  46.39 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  42.44 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_004310  BR2117  translation initiation factor IF-3  56.39 
 
 		 134 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1880  translation initiation factor IF-3  49.14 
 
 		 229 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10659 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2032  translation initiation factor IF-3  56.39 
 
 		 134 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  45.06 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  46.82 
 
 		 250 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  42.17 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  46.3 
 
 		 173 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  47.59 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  51.33 
 
 		 151 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  42.6 
 
 		 174 aa  155  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  44.91 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0065  translation initiation factor IF-3  53.73 
 
 		 145 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  43.42 
 
 		 165 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  47.22 
 
 		 146 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1733  translation initiation factor IF-3  42.7 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.128322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  44.51 
 
 		 227 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 174 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  45.57 
 
 		 179 aa  154  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 171 aa  154  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  40.78 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2098  translation initiation factor IF-3  50.69 
 
 		 147 aa  154  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  44.72 
 
 		 164 aa  154  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  45.18 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>