More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2357 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
127 aa  259  6.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  59.02 
 
 
126 aa  158  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 
125 aa  154  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 
125 aa  153  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 
125 aa  151  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 
126 aa  150  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 
126 aa  150  7e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  55.74 
 
 
126 aa  149  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  56.35 
 
 
126 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  55.74 
 
 
126 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 
125 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 
126 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 
127 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 
125 aa  147  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  58.68 
 
 
124 aa  147  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 
143 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
129 aa  144  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 
126 aa  145  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  144  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
126 aa  143  9e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
131 aa  142  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 
126 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 
140 aa  140  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 
129 aa  140  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3159  putative endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000982844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
127 aa  138  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 
128 aa  136  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  55.28 
 
 
125 aa  136  7.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 
127 aa  135  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 
128 aa  135  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 
124 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 
126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  52.85 
 
 
127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 
124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
128 aa  134  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 
122 aa  134  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 
124 aa  133  6.0000000000000005e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
124 aa  133  8e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  51.26 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 
129 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 
126 aa  131  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
124 aa  131  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
144 aa  131  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 
126 aa  131  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
128 aa  131  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 
126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  51.24 
 
 
156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
136 aa  130  6e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
125 aa  130  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  48.84 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  49.59 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  48.8 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 
123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  51.67 
 
 
124 aa  128  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
126 aa  128  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  47.97 
 
 
124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
129 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  49.18 
 
 
127 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
126 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
126 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  48.39 
 
 
126 aa  126  9.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  47.15 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 
132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  47.54 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  46.4 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 
124 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  46.34 
 
 
124 aa  124  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  46.34 
 
 
124 aa  124  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 
124 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 
124 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 
124 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 
124 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 
130 aa  125  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  124  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  43.9 
 
 
148 aa  124  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
127 aa  124  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  46.34 
 
 
127 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  46.92 
 
 
227 aa  124  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
127 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 
126 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  43.65 
 
 
128 aa  124  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  45.9 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 
125 aa  123  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>