More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2024 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  62.76 
 
 
533 aa  693    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
536 aa  1102    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  50.39 
 
 
535 aa  511  1e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  47.66 
 
 
531 aa  484  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  45.59 
 
 
534 aa  476  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  45.98 
 
 
542 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  45.44 
 
 
534 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  43.07 
 
 
535 aa  444  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  45.17 
 
 
530 aa  436  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  43.12 
 
 
534 aa  428  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  42.54 
 
 
544 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  42.78 
 
 
537 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  40.83 
 
 
535 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  41.68 
 
 
534 aa  396  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  40.15 
 
 
541 aa  385  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  39.85 
 
 
538 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  36.85 
 
 
538 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  36.48 
 
 
544 aa  323  5e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0728  extracellular solute-binding protein family 5  37.02 
 
 
535 aa  313  6.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  36.26 
 
 
552 aa  311  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  32.84 
 
 
530 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  32.5 
 
 
541 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  33.71 
 
 
530 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  33.03 
 
 
545 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3850  extracellular solute-binding protein family 5  34.21 
 
 
522 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  33.94 
 
 
547 aa  276  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  34.83 
 
 
536 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5413  4-phytase  31.87 
 
 
537 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4866  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 
537 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  32.36 
 
 
545 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 
526 aa  270  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1612  extracellular solute-binding protein family 5  31.96 
 
 
549 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 
547 aa  269  8e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 
550 aa  269  8.999999999999999e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0115  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  31.47 
 
 
536 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  34.63 
 
 
530 aa  268  2e-70  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0333  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 
528 aa  266  7e-70  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.31964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  32.56 
 
 
538 aa  265  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4730  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 
537 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  34.51 
 
 
526 aa  264  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0756  extracellular solute-binding protein family 5  30.57 
 
 
549 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 
525 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  33 
 
 
543 aa  263  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5318  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 
537 aa  263  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5542  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 
537 aa  263  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390888  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 
545 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3263  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 
537 aa  259  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35798  normal  0.0152453 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  31.57 
 
 
532 aa  258  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  32.86 
 
 
543 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 
525 aa  257  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.3 
 
 
532 aa  257  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  32.66 
 
 
543 aa  256  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 
549 aa  256  9e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  32.18 
 
 
535 aa  256  9e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003657  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  32.67 
 
 
536 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  32.66 
 
 
543 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  32.66 
 
 
543 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2437  extracellular solute-binding protein  31.89 
 
 
554 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  32.66 
 
 
543 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.63 
 
 
525 aa  253  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 
543 aa  253  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 
545 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.93 
 
 
545 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  31.93 
 
 
525 aa  252  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0546  4-phytase  32.06 
 
 
552 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633185  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.18 
 
 
525 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0623  4-phytase  32.06 
 
 
552 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000146122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  32.02 
 
 
538 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 
533 aa  250  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  32.8 
 
 
538 aa  250  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  32.8 
 
 
538 aa  250  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.39 
 
 
543 aa  249  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 
533 aa  248  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2242  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 
564 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  31.37 
 
 
560 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.19 
 
 
558 aa  247  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  33.67 
 
 
555 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  32.17 
 
 
558 aa  247  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 
542 aa  247  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 
544 aa  246  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  32.19 
 
 
558 aa  246  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 
558 aa  246  8e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.19 
 
 
558 aa  246  8e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  32.19 
 
 
543 aa  246  9e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.19 
 
 
543 aa  246  9e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.19 
 
 
543 aa  246  9e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  32.19 
 
 
543 aa  246  9e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2319  extracellular solute-binding protein family 5  31.66 
 
 
538 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2219  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  28.96 
 
 
550 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0351  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.21 
 
 
554 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  34.43 
 
 
529 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1534  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.21 
 
 
554 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1724  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.21 
 
 
554 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532344  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3019  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.21 
 
 
554 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2903  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.21 
 
 
554 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0385  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.21 
 
 
554 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.918509  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1253  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.02 
 
 
554 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 
545 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  31.31 
 
 
538 aa  243  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3340  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.72 
 
 
564 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>