More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1842 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1842  ribosomal protein S3  100 
 
 		 245 aa  502  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000278031  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  53.65 
 
 		 234 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  52.74 
 
 		 218 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  52.32 
 
 		 218 aa  242  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  52.65 
 
 		 237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  51.48 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  51.06 
 
 		 226 aa  240  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  51.77 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  51.77 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  51.5 
 
 		 223 aa  239  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 219 aa  238  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  50.88 
 
 		 235 aa  238  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  50.88 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  50.88 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  50.64 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  50.64 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  50.64 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  51.09 
 
 		 211 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  49.57 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  51.5 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  51.09 
 
 		 211 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  51.07 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 219 aa  232  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 219 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 219 aa  232  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 219 aa  232  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 219 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 219 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 219 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 219 aa  232  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 219 aa  232  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  51.32 
 
 		 210 aa  231  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  52 
 
 		 210 aa  231  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  50.64 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  52.44 
 
 		 224 aa  231  8.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 219 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  50.44 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  51.11 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0347  ribosomal protein S3  50.64 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.924426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  50.44 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  50.44 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 211 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  47.66 
 
 		 227 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  47.66 
 
 		 227 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0773  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 239 aa  229  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127701  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  48.33 
 
 		 223 aa  229  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  48.93 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  47.83 
 
 		 261 aa  228  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  49.36 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0591  30S ribosomal protein S3  45.63 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  50.88 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  49.13 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  49.36 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  51.11 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  49.36 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1027  30S ribosomal protein S3  50.83 
 
 		 232 aa  227  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000269281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  50.44 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0292  30S ribosomal protein S3  49.38 
 
 		 241 aa  227  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 232 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1771  30S ribosomal protein S3  51.54 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000585037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  48.1 
 
 		 219 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 217 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 217 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  48.92 
 
 		 214 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  51.33 
 
 		 230 aa  225  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  48.93 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  52 
 
 		 228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  49.33 
 
 		 222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  45.73 
 
 		 221 aa  225  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  50 
 
 		 226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0288  30S ribosomal protein S3  48.5 
 
 		 240 aa  225  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  52.44 
 
 		 228 aa  224  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  49.33 
 
 		 229 aa  224  7e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  49.12 
 
 		 217 aa  224  8e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  49.36 
 
 		 231 aa  224  8e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  51.97 
 
 		 228 aa  224  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  51.97 
 
 		 228 aa  224  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0503  ribosomal protein S3  51.77 
 
 		 220 aa  224  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.216514  hitchhiker  0.000000000339097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  49.36 
 
 		 231 aa  224  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  51.97 
 
 		 228 aa  224  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0333  ribosomal protein S3  51.77 
 
 		 228 aa  224  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  50.44 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1940  30S ribosomal protein S3  48.93 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  47.81 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  49.56 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  50.44 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  50.44 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  47.62 
 
 		 222 aa  224  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  50.44 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  50.44 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  50.67 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  47.26 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  48.28 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  50.67 
 
 		 233 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  47.64 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>