More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0846 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  40.85 
 
 
6889 aa  1051    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  43.2 
 
 
1489 aa  696    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  45.1 
 
 
3090 aa  769    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4625  amino acid adenylation domain-containing protein  39.67 
 
 
1153 aa  726    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0810098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  42.52 
 
 
1497 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  37.75 
 
 
1488 aa  680    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  41.85 
 
 
1416 aa  661    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  38.57 
 
 
995 aa  691    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  46.49 
 
 
4646 aa  791    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  38.77 
 
 
2316 aa  664    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  43.48 
 
 
4186 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  45.53 
 
 
3130 aa  748    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  45.95 
 
 
2498 aa  763    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5163  amino acid adenylation domain protein  39.78 
 
 
1174 aa  734    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0962638  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
2710 aa  5561    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5090  amino acid adenylation domain protein  39.51 
 
 
1153 aa  728    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731614  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  37.79 
 
 
3099 aa  922    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  41.8 
 
 
974 aa  643    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  37.56 
 
 
3308 aa  641    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  45.69 
 
 
1424 aa  842    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  37.72 
 
 
1786 aa  1163    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  46.37 
 
 
1520 aa  770    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  42.94 
 
 
2273 aa  1268    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  44.78 
 
 
1646 aa  1403    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  37.48 
 
 
1093 aa  699    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  48.82 
 
 
3335 aa  1525    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0189  polyketide synthase peptide synthetase fusion protein  32.97 
 
 
3133 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  43.76 
 
 
1833 aa  728    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  44.31 
 
 
2604 aa  700    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  45.38 
 
 
3089 aa  781    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  44.52 
 
 
1466 aa  695    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  52.25 
 
 
2684 aa  2690    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  31.24 
 
 
3739 aa  894    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  46.16 
 
 
3108 aa  738    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  35.34 
 
 
3235 aa  663    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  48.39 
 
 
1574 aa  843    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1211  polyketide synthase  30.54 
 
 
3044 aa  1006    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165811  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  41.72 
 
 
1486 aa  649    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  47.01 
 
 
3093 aa  779    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  47.76 
 
 
2682 aa  2384    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  34.1 
 
 
2943 aa  772    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  30.21 
 
 
3718 aa  1090    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  40.79 
 
 
2150 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  42.98 
 
 
4647 aa  716    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  38.7 
 
 
1472 aa  656    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  50.24 
 
 
2679 aa  2627    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  42.25 
 
 
1909 aa  739    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  41.27 
 
 
2176 aa  1204    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  36.74 
 
 
4478 aa  1568    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  41.9 
 
 
1302 aa  785    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  40.49 
 
 
1612 aa  681    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  47.12 
 
 
1911 aa  746    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  40.46 
 
 
2093 aa  659    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  37.11 
 
 
1408 aa  681    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  38.7 
 
 
1472 aa  656    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  46.92 
 
 
1560 aa  756    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  45.8 
 
 
1582 aa  778    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  43.16 
 
 
1470 aa  692    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  44.4 
 
 
1535 aa  732    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  44.53 
 
 
2454 aa  1215    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  44.04 
 
 
1795 aa  726    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  40.49 
 
 
1612 aa  680    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  38.5 
 
 
995 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1677  non-ribosomal peptide synthase  32.76 
 
 
3157 aa  694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  41.91 
 
 
4265 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  41.2 
 
 
1466 aa  664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  44.1 
 
 
1653 aa  798    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  38.8 
 
 
1472 aa  657    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1595  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  32.87 
 
 
3148 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  41.8 
 
 
4239 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  36.91 
 
 
2581 aa  637  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  41.8 
 
 
4265 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  38.09 
 
 
4747 aa  631  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  27.59 
 
 
4354 aa  629  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  36.23 
 
 
2033 aa  624  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  36.46 
 
 
5953 aa  621  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  37.51 
 
 
6403 aa  618  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  38.43 
 
 
3194 aa  613  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  41.36 
 
 
3133 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  38.63 
 
 
2462 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  41.36 
 
 
3127 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  36.06 
 
 
3432 aa  603  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  35.33 
 
 
3498 aa  601  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2033  amino acid adenylation domain protein  36.68 
 
 
1740 aa  596  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  36.94 
 
 
1668 aa  595  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  36.24 
 
 
1129 aa  593  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  35.9 
 
 
1114 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  35.59 
 
 
4502 aa  593  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  36.87 
 
 
4991 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  33.99 
 
 
1087 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  34.87 
 
 
6676 aa  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  35.3 
 
 
2867 aa  586  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  34.3 
 
 
1556 aa  587  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.03 
 
 
2551 aa  587  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  36.79 
 
 
3176 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  34.91 
 
 
3086 aa  583  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  34.85 
 
 
3086 aa  583  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.11 
 
 
4531 aa  580  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  33.88 
 
 
1142 aa  577  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  38.04 
 
 
1656 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>