65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28750 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28750  putative effector of murein hydrolase LrgA  100 
 
 		 161 aa  287  4e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4094  LrgA  62.5 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2234  LrgA family protein  51.64 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  40.5 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  41.94 
 
 		 123 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  36.89 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  41.03 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  29.66 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  40.91 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  41.12 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  36 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  34.48 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  34.38 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  42.5 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003697  antiholin-like protein LrgA  35.71 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  41.38 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  36.07 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  41.73 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  41.23 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  26.21 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  39.13 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0854  hypothetical protein  33.05 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  31.78 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  39.13 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  35.51 
 
 		 130 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  34.38 
 
 		 128 aa  52  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  34.38 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  34.51 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  37.38 
 
 		 113 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  31.4 
 
 		 125 aa  50.8  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  37.6 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  28.83 
 
 		 130 aa  50.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  37.23 
 
 		 125 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  30.58 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  35.71 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  35.45 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  39.5 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  46.84 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  37.74 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0735  LrgA family protein  38.98 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  39.05 
 
 		 119 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  31.25 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  48.05 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  48.05 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  48.05 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0493  LrgA  46 
 
 		 132 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0706  LrgA family protein  31.71 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  28.1 
 
 		 118 aa  44.7  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  38.4 
 
 		 130 aa  44.3  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  32.46 
 
 		 117 aa  43.9  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  29.31 
 
 		 115 aa  43.9  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  30.91 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  31.58 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0636  LrgA  36.44 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  27.64 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  37.25 
 
 		 117 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  31.37 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  43.21 
 
 		 123 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  42  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0155  putative LrgA family protein  46.67 
 
 		 118 aa  42  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  33 
 
 		 121 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  30.3 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0624  LrgA  36.76 
 
 		 128 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.938941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  40.21 
 
 		 119 aa  40.8  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0332  LrgA  42 
 
 		 127 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>