More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20150 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_20150  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  100 
 
 
285 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0951838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1401  ABC transporter related  63.86 
 
 
291 aa  343  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2623  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  51.06 
 
 
338 aa  268  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.675572  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1484  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.88 
 
 
376 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  0.667215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1679  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.52 
 
 
347 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34890  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  54.02 
 
 
289 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2513  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.83 
 
 
389 aa  258  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313855  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0042  ABC transporter related  54.51 
 
 
267 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2072  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.88 
 
 
348 aa  252  6e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0237279  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01350  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  55.28 
 
 
286 aa  248  8e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2724  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.36 
 
 
353 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.632529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21780  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  47.16 
 
 
360 aa  245  6.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.392521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7460  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  51.25 
 
 
317 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0931  ABC transporter related protein  51.53 
 
 
265 aa  238  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2393  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.73 
 
 
347 aa  232  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6185  ABC transporter related  51.67 
 
 
285 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3403  ABC transporter related  48.35 
 
 
538 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4715  ABC transporter related  47.74 
 
 
326 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1182  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.65 
 
 
333 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.637692  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0549  ABC oligopeptide/dipeptide transporter ATP-binding protein  43.02 
 
 
328 aa  222  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.824636  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2580  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, ATP-binding protein  38.75 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 
354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002582  (GlcNAc)2 ABC transporter ATP-binding component 2  39.26 
 
 
331 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000989  oligopeptide transport ATP-binding protein OppF  40.68 
 
 
310 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  43.86 
 
 
623 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03427  hypothetical protein  39.11 
 
 
331 aa  219  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5672  ABC transporter related  46.34 
 
 
314 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1552  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.51 
 
 
324 aa  218  7e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1333  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.6 
 
 
343 aa  218  7e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  41.42 
 
 
308 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17720  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.77 
 
 
276 aa  217  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.7 
 
 
327 aa  217  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0066  ABC transporter related protein  41.09 
 
 
303 aa  216  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0562  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.75 
 
 
323 aa  216  4e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00149525 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  44.15 
 
 
549 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1745  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.23 
 
 
324 aa  216  4e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0156804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0402  ABC transporter related  46.92 
 
 
374 aa  215  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0245246  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1732  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 
321 aa  215  7e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.561922  hitchhiker  0.00101303 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1340  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  42.05 
 
 
342 aa  215  8e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.801873 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1634  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.33 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.666215  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0145  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  47.19 
 
 
600 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1220  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.56 
 
 
349 aa  212  5.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.585278  normal  0.0173539 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 
629 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1665  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.3 
 
 
325 aa  212  7e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 
623 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1896  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 
324 aa  211  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 
623 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 
623 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  43.27 
 
 
625 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3819  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.04 
 
 
336 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.83 
 
 
612 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  44.83 
 
 
623 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0456  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 
335 aa  210  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 
623 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3794  ABC transporter related  45.1 
 
 
377 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 
623 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2200  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.62 
 
 
332 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.492449  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  44.83 
 
 
612 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 
623 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 
623 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 
623 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 
623 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 
623 aa  210  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1846  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.54 
 
 
450 aa  208  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.231668  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  40.07 
 
 
549 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.38 
 
 
326 aa  208  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00804417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4401  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.4 
 
 
325 aa  208  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.433175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6951  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 
332 aa  208  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D20  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  39.85 
 
 
319 aa  207  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6652  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 
355 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1192  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.08 
 
 
324 aa  207  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.794758  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 
326 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6688  ABC transporter related  45.96 
 
 
299 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157267  normal  0.337888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06420  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.33 
 
 
582 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104627  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  41.92 
 
 
609 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  40.81 
 
 
552 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8930  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 
337 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 
632 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0063  ABC transporter related  41.22 
 
 
282 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0307573  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.54 
 
 
320 aa  205  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5784  ABC transporter related  45.53 
 
 
299 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0699295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  41.43 
 
 
615 aa  205  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.63 
 
 
336 aa  205  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0366  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 
331 aa  205  8e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  41.79 
 
 
593 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  40.36 
 
 
349 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  45.61 
 
 
542 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  41.67 
 
 
545 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.79 
 
 
633 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  43.22 
 
 
558 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5508  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  39.93 
 
 
355 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.444532 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3967  hypothetical protein  42.21 
 
 
282 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420932  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1292  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.43 
 
 
352 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00715286  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1215  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.21 
 
 
362 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  38.81 
 
 
530 aa  203  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  44.67 
 
 
542 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.46 
 
 
633 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2505  ABC transporter related protein  42.22 
 
 
279 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.559192  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>