More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09170 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_09170  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  100 
 
 
475 aa  951    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5390  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  55.74 
 
 
465 aa  495  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10080  mycothione reductase  53.49 
 
 
466 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0975361  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  53.62 
 
 
460 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.04 
 
 
477 aa  418  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2130  mycothione reductase  48.32 
 
 
464 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.68 
 
 
469 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.78 
 
 
478 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2298  mycothione reductase  45.17 
 
 
469 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1643  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.63 
 
 
474 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000472029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4054  mycothione reductase  45.7 
 
 
470 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  45.67 
 
 
459 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2113  mycothione reductase  44.33 
 
 
470 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207955  normal  0.0141084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2067  mycothione reductase  44.33 
 
 
470 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2050  mycothione reductase  44.33 
 
 
470 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1696  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  45.55 
 
 
469 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142602  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08580  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  44.09 
 
 
467 aa  372  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.745964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  42.98 
 
 
487 aa  355  8.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.162356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  42.05 
 
 
468 aa  346  7e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.53 
 
 
462 aa  259  6e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  34.57 
 
 
484 aa  257  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2696  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.78 
 
 
476 aa  249  7e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303551  normal  0.202311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1783  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.59 
 
 
475 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.58 
 
 
487 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.81 
 
 
536 aa  236  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1804  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.8 
 
 
528 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2738  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  32.79 
 
 
488 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
457 aa  227  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  30.26 
 
 
546 aa  224  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  30.26 
 
 
546 aa  224  4e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  31 
 
 
469 aa  223  4e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.372731  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.14 
 
 
455 aa  220  5e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.26 
 
 
459 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  29.03 
 
 
460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  30.28 
 
 
460 aa  213  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  33.19 
 
 
767 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.79 
 
 
458 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.93 
 
 
467 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  30.24 
 
 
546 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  34.38 
 
 
467 aa  206  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  34.15 
 
 
503 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  29.38 
 
 
464 aa  203  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.02 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  29.38 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  32.68 
 
 
745 aa  201  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.49 
 
 
456 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  31.11 
 
 
466 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.7 
 
 
465 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.27 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.12 
 
 
478 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  31.12 
 
 
466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.12 
 
 
478 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.95 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.28 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  32.1 
 
 
767 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.19 
 
 
471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.79 
 
 
464 aa  196  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  31.2 
 
 
467 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  30.35 
 
 
459 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.45 
 
 
467 aa  196  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.63 
 
 
459 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  32.02 
 
 
479 aa  196  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.53 
 
 
464 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  32.39 
 
 
548 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  32.92 
 
 
460 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  30.87 
 
 
461 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.03 
 
 
467 aa  193  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  30.22 
 
 
475 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.29 
 
 
468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  30.79 
 
 
478 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.27 
 
 
468 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.48 
 
 
593 aa  189  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.15 
 
 
478 aa  189  9e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  32.27 
 
 
459 aa  189  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.08 
 
 
462 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.9 
 
 
464 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.79 
 
 
478 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  29.88 
 
 
459 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  29.2 
 
 
546 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  30.23 
 
 
590 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.19 
 
 
466 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  29.67 
 
 
459 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.19 
 
 
460 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.32 
 
 
462 aa  187  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  30.96 
 
 
457 aa  187  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.17 
 
 
459 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.73 
 
 
471 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1472  mercuric reductase  33.64 
 
 
473 aa  186  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.505901  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.77 
 
 
478 aa  186  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.72 
 
 
488 aa  186  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.17 
 
 
496 aa  186  8e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.15 
 
 
465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  31.02 
 
 
468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  28.78 
 
 
453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.31 
 
 
481 aa  186  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.36 
 
 
478 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.16 
 
 
478 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  30.07 
 
 
479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.12 
 
 
479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  30.33 
 
 
468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>