258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01560 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 362 aa  736    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0585  Oxidoreductase domain  61.69 
 
 		 362 aa  461  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  62.88 
 
 		 360 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  59.6 
 
 		 391 aa  447  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  57.7 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  55.34 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  49.44 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  50.6 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  48.05 
 
 		 335 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0267  oxidoreductase domain protein  45.35 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0049  oxidoreductase domain protein  45.24 
 
 		 391 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595236  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2442  oxidoreductase domain-containing protein  46.38 
 
 		 342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  48.95 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  45.32 
 
 		 336 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  44.48 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  44.21 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  46.08 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  38.62 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1916  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0311153  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  23.24 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  22.48 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  24.27 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.56 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  22.26 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  24.88 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  24.88 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  23.43 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  28.7 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  26.75 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.67 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  25.56 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  26.07 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.27 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  26.27 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.75 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  24.5 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  27.02 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  23.08 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  24.29 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 667 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  24.5 
 
 		 345 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  24.3 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  25.44 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  31.71 
 
 		 326 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  24.3 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  24.54 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25.36 
 
 		 349 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25.1 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 334 aa  53.5  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 		 337 aa  53.5  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  23.04 
 
 		 315 aa  53.1  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  26.53 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 394 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.3 
 
 		 357 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  26.19 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  26.53 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  25.85 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  26.53 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  26.53 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  25.33 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.4 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  24.85 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.81 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  26.53 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.81 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.4 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  24.42 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1238  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  29.82 
 
 		 351 aa  51.2  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  25.85 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  28.37 
 
 		 366 aa  50.1  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 		 386 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 		 357 aa  50.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>