161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4688 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_4959  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  97 
 
 
367 aa  723    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5002  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  96.73 
 
 
367 aa  722    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4739  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  97.55 
 
 
367 aa  728    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4579  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  97 
 
 
367 aa  725    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4598  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  97.28 
 
 
367 aa  725    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5099  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  97.55 
 
 
367 aa  728    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4987  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  97 
 
 
367 aa  723    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0261  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  97.28 
 
 
367 aa  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.262008  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4974  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  97.28 
 
 
367 aa  726    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4688  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  100 
 
 
367 aa  743    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0918  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  49.17 
 
 
372 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0430  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  48.77 
 
 
372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3153  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  47.15 
 
 
373 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4375  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  49.57 
 
 
372 aa  329  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.417275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4847  hypothetical protein  48.08 
 
 
372 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.601246  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4728  hypothetical protein  48.08 
 
 
372 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4792  hypothetical protein  48.08 
 
 
372 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4697  hypothetical protein  47.8 
 
 
372 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.547246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4826  hypothetical protein  47.8 
 
 
372 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0105  hypothetical protein  46.4 
 
 
348 aa  301  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3993  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  44.23 
 
 
369 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3975  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  44.51 
 
 
369 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4098  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  43.96 
 
 
369 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4047  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  44.92 
 
 
369 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0548491 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4161  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  43.96 
 
 
369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  0.579159 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3866  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  46.13 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.559786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0676  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  46.13 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3272  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  43.56 
 
 
369 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2990  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  38.52 
 
 
398 aa  229  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625674  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5759  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  37.23 
 
 
398 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646746  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6666  L-seryl-tRNA selenium transferase  37.16 
 
 
398 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184749  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5094  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase  36.61 
 
 
398 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2704  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  37.32 
 
 
402 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249088  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0940  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  32.31 
 
 
400 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3968  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase protein  32.07 
 
 
406 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456181  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1144  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  28.2 
 
 
388 aa  126  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.46182  normal  0.521262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6463  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  30.37 
 
 
414 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2440  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  28.36 
 
 
406 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0244624  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3964  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  29.25 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1021  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  25.13 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0099  L-seryl-tRNA selenium transferase  27 
 
 
406 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.789274  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0175  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  27.66 
 
 
411 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0481  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  26.96 
 
 
511 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11487  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4157  selenocysteine synthase  28.52 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.109282 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0672  selenocysteine synthase  26.32 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  26.89 
 
 
462 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2186  selenocysteine synthase  27.43 
 
 
475 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000130274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2373  selenocysteine synthase  26.7 
 
 
462 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0488  L-seryl-tRNA selenium transferase  27.61 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1646  selenocysteine synthase  25.96 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000318162  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3540  selenocysteine synthase  26.38 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.607599  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6556  selenocysteine synthase  26.41 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0759041  decreased coverage  0.00101657 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1162  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  25.71 
 
 
476 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103584 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678.1  selenocysteine synthase  25.86 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0726  selenocysteine synthase  25.86 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3988  selenocysteine synthase  26.38 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1696  selenocysteine synthase  25.86 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1903  selenocysteine synthase  25.86 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2255  selenocysteine synthase  25.86 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0575  selenocysteine synthase  25.86 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81182  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4522  selenocysteine synthase  25.93 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2392  selenocysteine synthase  25.86 
 
 
480 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.36039  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0711  selenocysteine synthase  29.28 
 
 
495 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3381  selenocysteine synthase  24.58 
 
 
478 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3486  selenocysteine synthase  24.81 
 
 
484 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0801308  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0873  selenocysteine synthase  25.4 
 
 
468 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0441  selenocysteine synthase  25.68 
 
 
491 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3883  selenocysteine synthase  24.58 
 
 
479 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0440  selenocysteine synthase  25.34 
 
 
491 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1569  selenocysteine synthase  28.39 
 
 
440 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.339371  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0819  selenocysteine synthase  25.83 
 
 
461 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2549  selenocysteine synthase  28.02 
 
 
476 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0106  selenocysteine synthase  28.23 
 
 
476 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0101  selenocysteine synthase  28.23 
 
 
473 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1740  selenocysteine synthase  24.84 
 
 
475 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.820555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0105  selenocysteine synthase  27.75 
 
 
473 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2561  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  24.8 
 
 
470 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0106  selenocysteine synthase  28.23 
 
 
476 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4593  selenocysteine synthase  28.73 
 
 
500 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.263518  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1093  selenocysteine synthase  23.96 
 
 
473 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  23.33 
 
 
466 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2477  selenocysteine synthase  24.91 
 
 
448 aa  60.5  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0104  selenocysteine synthase  27.75 
 
 
476 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0109  selenocysteine synthase  27.75 
 
 
476 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2965  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  29.95 
 
 
446 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158372  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0108  selenocysteine synthase  27.27 
 
 
476 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3879  selenocysteine synthase  25.35 
 
 
468 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797755 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1380  selenocysteine synthase  28.87 
 
 
440 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.924415  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0812  L-seryl-tRNA selenium transferase  24.56 
 
 
468 aa  59.7  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4162  selenocysteine synthase  24.12 
 
 
462 aa  59.7  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4115  selenocysteine synthase  24 
 
 
462 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3766  selenocysteine synthase  24 
 
 
462 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0042  selenocysteine synthase  24 
 
 
462 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2096  selenocysteine synthase  27.62 
 
 
479 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.247494  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3059  selenocysteine synthase  25.46 
 
 
483 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00615002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0412  selenocysteine synthase  25.75 
 
 
491 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4267  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  24.5 
 
 
476 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000207221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2208  L-seryl-tRNA selenium transferase  26.11 
 
 
519 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.223965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1814  selenocysteine synthase  25.29 
 
 
465 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.071718 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2504  selenocysteine synthase  24.79 
 
 
470 aa  58.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0196405  normal  0.0690834 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>