More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3016 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3016  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  564  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3099  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00609185  decreased coverage  0.00847969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 166 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  25.65 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 128 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5291  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 145 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  32.99 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  24.63 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5640  transcriptional regulator, MerR family  30.3 
 
 		 334 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 136 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  21.72 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 136 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0537  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 160 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.400616  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  33.33 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3837  MerR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 139 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265561  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3589  MerR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 137 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 141 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2769  transcriptional regulator, MerR family  28.08 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.545239  normal  0.552398 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  36.99 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 141 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  27.78 
 
 		 141 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  25.62 
 
 		 214 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 341 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  27.13 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  28.89 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 138 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  25 
 
 		 143 aa  53.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  27.78 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  27.78 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4273  MerR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 139 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3049  MerR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 335 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  27.78 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  27.78 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  27.78 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  25.62 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  27.78 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  27.78 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  27.35 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  27.78 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40 
 
 		 135 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40 
 
 		 135 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 141 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 141 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  30.48 
 
 		 133 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 141 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  40 
 
 		 135 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 135 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40 
 
 		 135 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40 
 
 		 135 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40 
 
 		 135 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  43.28 
 
 		 127 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  31.37 
 
 		 124 aa  52.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  26.61 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  29.57 
 
 		 131 aa  52.8  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  26.85 
 
 		 141 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  26.85 
 
 		 141 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40 
 
 		 135 aa  52.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 146 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3063  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858131  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 		 142 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>