More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2223 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  100 
 
 
249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  79.12 
 
 
249 aa  417  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  79.52 
 
 
249 aa  418  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  79.52 
 
 
249 aa  418  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  79.52 
 
 
249 aa  418  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  79.52 
 
 
249 aa  418  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  78.31 
 
 
249 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  78.71 
 
 
249 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  78.31 
 
 
249 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  77.51 
 
 
249 aa  408  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  77.51 
 
 
249 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
251 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
258 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0894  short chain dehydrogenase  35.92 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.211983  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0959  short chain dehydrogenase  35.92 
 
 
246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
256 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0899775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1035  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 
256 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
270 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11649  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  37.66 
 
 
272 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1029  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 
246 aa  159  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
258 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0532431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
260 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
260 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 
249 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0219  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
246 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1931  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
246 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2209  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
246 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1673  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
246 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0309  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
246 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1234  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
279 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0946  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
253 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  31.49 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  31.49 
 
 
254 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  30.64 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  31.49 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 
252 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  30.64 
 
 
253 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  30.64 
 
 
253 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  34.43 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0225  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 
311 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3544  short chain dehydrogenase  31.43 
 
 
246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16365  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
260 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  32.79 
 
 
253 aa  102  8e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0765  hypothetical protein  33.06 
 
 
253 aa  95.1  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0066  dehydrogenase/reductase  28.39 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301861 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0747  hypothetical protein  29.54 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01740  cytoplasm protein, putative  30.8 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672483  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.37 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.64 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.89 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0422  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.75 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.46 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1632  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008135 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09357  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02370)  27.98 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00364064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.17 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  29.29 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.17 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0994  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  30.29 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.41 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198108  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  30.96 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0914  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.331162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.31 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
254 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
241 aa  79  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  27.36 
 
 
229 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.87 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
241 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699599  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.98 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.16 
 
 
705 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5763  short chain dehydrogenase  28.94 
 
 
222 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5387  short chain dehydrogenase  28.94 
 
 
222 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5476  short chain dehydrogenase  28.94 
 
 
222 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0679291  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06330  oxidoreductase  28.21 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.646831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  31.37 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.51 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00161492  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05911  short chain dehydrogenase  30.26 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  28.68 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0189644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0259595  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  29.48 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45294  predicted protein  24.34 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362756  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.43 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0206025  normal  0.910086 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003615  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  26.86 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05611  short chain dehydrogenase  30.05 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.713488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>