More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0939 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
323 aa  678    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.7 
 
 
322 aa  485  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.32 
 
 
322 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.39 
 
 
322 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.7 
 
 
322 aa  484  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.39 
 
 
322 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.18 
 
 
323 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.08 
 
 
322 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.08 
 
 
322 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  66.56 
 
 
323 aa  477  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1124  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.8 
 
 
323 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0644506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.76 
 
 
362 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.44 
 
 
342 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.45 
 
 
352 aa  411  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.66 
 
 
329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60 
 
 
330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.81 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.6 
 
 
318 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.81 
 
 
336 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.5 
 
 
336 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.76 
 
 
348 aa  392  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.94 
 
 
336 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.04 
 
 
342 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.56 
 
 
327 aa  384  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.23 
 
 
334 aa  386  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.01 
 
 
341 aa  378  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.17 
 
 
340 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.18 
 
 
358 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.79 
 
 
358 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.26 
 
 
351 aa  376  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.35 
 
 
320 aa  375  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.59 
 
 
341 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.6 
 
 
339 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.6 
 
 
352 aa  372  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.8 
 
 
337 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.92 
 
 
340 aa  371  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.08 
 
 
351 aa  368  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.74 
 
 
355 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.48 
 
 
318 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0503  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.47 
 
 
351 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0802438  normal  0.0327306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.27 
 
 
357 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0307  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.16 
 
 
339 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.05 
 
 
355 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.76 
 
 
340 aa  364  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.86 
 
 
323 aa  364  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.46 
 
 
362 aa  363  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.29 
 
 
355 aa  363  3e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.610294  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.05 
 
 
359 aa  362  4e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.51 
 
 
354 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.52 
 
 
357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.17 
 
 
354 aa  356  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0482  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.05 
 
 
349 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0600  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.05 
 
 
349 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0365968  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.12 
 
 
367 aa  355  7.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.08 
 
 
352 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.79 
 
 
364 aa  354  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.89 
 
 
356 aa  354  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.87 
 
 
356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.449381  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.01 
 
 
355 aa  352  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.04 
 
 
346 aa  352  4e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.92 
 
 
357 aa  352  5e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1749  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.07 
 
 
354 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.24 
 
 
318 aa  351  8.999999999999999e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.47 
 
 
337 aa  351  8.999999999999999e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.18378  hitchhiker  0.0000000578516 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.34 
 
 
353 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1986  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.3 
 
 
352 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1995  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.98 
 
 
357 aa  350  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.10362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.51 
 
 
355 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1797  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.43 
 
 
338 aa  349  4e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.37 
 
 
356 aa  349  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.63 
 
 
354 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  55.11 
 
 
360 aa  349  4e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6255  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.66 
 
 
353 aa  348  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849165  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1491  dTDP-D-glucose-46-dehydratase  50 
 
 
352 aa  349  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2008  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.78 
 
 
366 aa  348  7e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.47 
 
 
355 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.47 
 
 
355 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.47 
 
 
355 aa  347  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  51.47 
 
 
355 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3491  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.65 
 
 
354 aa  347  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.370229 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.12 
 
 
350 aa  347  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2735  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.55 
 
 
354 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1272  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.89 
 
 
351 aa  346  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.447034 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0243  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  52.2 
 
 
363 aa  346  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1183  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.48 
 
 
351 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.769877  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0180  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  52.2 
 
 
363 aa  346  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1538  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.25 
 
 
336 aa  346  3e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00186226  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.6 
 
 
350 aa  346  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.13 
 
 
355 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1618  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.52 
 
 
359 aa  346  3e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4166  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.95 
 
 
361 aa  346  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.167438  normal  0.0625555 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0682  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  51.35 
 
 
354 aa  346  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0195  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.27 
 
 
353 aa  346  4e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1441  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.45 
 
 
362 aa  345  5e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.47 
 
 
328 aa  345  5e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.226707  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2456  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.26 
 
 
353 aa  345  5e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.25 
 
 
355 aa  345  5e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4022  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.51 
 
 
360 aa  345  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.37 
 
 
353 aa  345  7e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.850535  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.3 
 
 
355 aa  345  7e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>