More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2369 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2369  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
325 aa  614  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.312447  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2214  monosaccharide-transporting ATPase  68.23 
 
 
327 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0519028  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2237  monosaccharide-transporting ATPase  68.23 
 
 
327 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  41.46 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4366  Monosaccharide-transporting ATPase  40.07 
 
 
323 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  38.85 
 
 
345 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.85 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  39.1 
 
 
350 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  37.82 
 
 
333 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  40 
 
 
310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 
311 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  38.18 
 
 
311 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  38.18 
 
 
311 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.66 
 
 
310 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.84 
 
 
311 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 
311 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 
311 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  37.84 
 
 
311 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  37.5 
 
 
311 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  37.5 
 
 
311 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 
835 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.81 
 
 
330 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.81 
 
 
330 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.81 
 
 
330 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 
334 aa  159  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 
334 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  40.96 
 
 
314 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.94 
 
 
311 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  34.67 
 
 
327 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  34.67 
 
 
327 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  38.75 
 
 
372 aa  156  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  36.23 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  35.99 
 
 
352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  41.49 
 
 
344 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  41.49 
 
 
344 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  42.75 
 
 
347 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  40.68 
 
 
334 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  34.38 
 
 
326 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  39.35 
 
 
337 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  39.35 
 
 
337 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  39.35 
 
 
337 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  39.35 
 
 
337 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  36.04 
 
 
334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  38.11 
 
 
338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  37.88 
 
 
345 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  40.78 
 
 
339 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  37.88 
 
 
345 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  36.43 
 
 
324 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  39.03 
 
 
337 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  38.75 
 
 
372 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  37.55 
 
 
405 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  37.55 
 
 
405 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  37.55 
 
 
405 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  38.83 
 
 
326 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1352  Monosaccharide-transporting ATPase  38.24 
 
 
345 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.884414  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  37.58 
 
 
345 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40.67 
 
 
309 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  38.96 
 
 
335 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  33.94 
 
 
331 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  35.37 
 
 
342 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  35.37 
 
 
342 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
345 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7476  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37 
 
 
334 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  35.37 
 
 
342 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  39.16 
 
 
337 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.97 
 
 
345 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  38.29 
 
 
358 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  39.35 
 
 
337 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.02 
 
 
324 aa  149  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  39.22 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  36.67 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  36.83 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  36.67 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  36.45 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4659  monosaccharide-transporting ATPase  34.95 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  36.67 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  38.46 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2024  inner-membrane translocator  40.43 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.88 
 
 
334 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  35.15 
 
 
335 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  37.88 
 
 
334 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  33.44 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 
342 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  34.85 
 
 
334 aa  146  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  41.57 
 
 
343 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  41.29 
 
 
312 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 
341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  33.66 
 
 
309 aa  145  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  33.55 
 
 
317 aa  145  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
331 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  38.02 
 
 
337 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 
329 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  39.63 
 
 
348 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  37.55 
 
 
342 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2928  monosaccharide-transporting ATPase  37.04 
 
 
351 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110864  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  36.65 
 
 
336 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  41.13 
 
 
344 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2118  monosaccharide-transporting ATPase  36.16 
 
 
368 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>