More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5264 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5264  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  100 
 
 
287 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.764411  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1977  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  97.21 
 
 
287 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0142603 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1953  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  97.91 
 
 
297 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1316  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  92.61 
 
 
296 aa  507  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823499  normal  0.0105684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1940  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  93.01 
 
 
297 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.300274  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6125  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  98.03 
 
 
264 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1867  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  93.71 
 
 
287 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0147455 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2076  oxidoreductase  84.23 
 
 
315 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2417  hypothetical protein  82.33 
 
 
295 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2375  hypothetical protein  83.15 
 
 
312 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2523  6-phosphogluconate dehydrogenase  82.08 
 
 
281 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1286  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  67.26 
 
 
297 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.648289  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2316  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  70.88 
 
 
355 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1143  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.5 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1177  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.14 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.383553  normal  0.478459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1160  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.5 
 
 
295 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206524  normal  0.0135112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4274  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.43 
 
 
295 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347219  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6400  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.14 
 
 
297 aa  235  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21180  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.43 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.542348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1251  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  46.43 
 
 
298 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3196  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.71 
 
 
296 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1807  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.52 
 
 
296 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5161  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  46.35 
 
 
297 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1523  putative dehydrogenase  47.31 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.041306  normal  0.892116 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.15 
 
 
299 aa  191  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3270  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.37 
 
 
298 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0902  putative dehydrogenase  46.18 
 
 
301 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192068 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.86 
 
 
294 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0860064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0958  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.96 
 
 
299 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  40.21 
 
 
290 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.46 
 
 
300 aa  178  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.82 
 
 
292 aa  178  9e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7094  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.61 
 
 
293 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.15 
 
 
297 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.69 
 
 
296 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3089  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.05 
 
 
297 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1500  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.49 
 
 
299 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.921564  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3294  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.36 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738468  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1632  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.49 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3094  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.1 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3351  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.28 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561404  hitchhiker  0.00525216 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1133  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.78 
 
 
301 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3480  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.07 
 
 
304 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1704  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.07 
 
 
308 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3153  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.07 
 
 
304 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3283  transmembrane 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase oxidoreductase protein  40.07 
 
 
303 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3102  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.86 
 
 
293 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3450  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.99 
 
 
307 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1600  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.86 
 
 
293 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4513  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.41 
 
 
297 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0726743  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0627  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.04 
 
 
292 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1123  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.91 
 
 
299 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.356226 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5035  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.78 
 
 
294 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6528  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.64 
 
 
297 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186276  normal  0.100696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3337  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.27 
 
 
297 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2119  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.69 
 
 
304 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0276919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.23 
 
 
291 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3293  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.27 
 
 
306 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0573  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.68 
 
 
292 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6412  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.5 
 
 
297 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00524368  normal  0.397204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.91 
 
 
296 aa  168  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0891841  normal  0.489794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0568  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.68 
 
 
292 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0566  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.68 
 
 
292 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0693  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  42.01 
 
 
305 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.682361  normal  0.0958689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4563  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.43 
 
 
309 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.386042 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.86 
 
 
294 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0485372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1570  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.13 
 
 
297 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101448  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2972  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.01 
 
 
310 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.856928  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3038  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.59 
 
 
295 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.77 
 
 
297 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0721878  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4299  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.77 
 
 
297 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0565  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  42.55 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.64 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0261  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  39.62 
 
 
305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0646517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43420  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.23 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.164862  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3956  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.91 
 
 
302 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  35.68 
 
 
289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  33.94 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase GcxR  36.36 
 
 
295 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.902474  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2821  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  39.92 
 
 
289 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.27 
 
 
283 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8654  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  43.73 
 
 
295 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0552  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.86 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3760  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.35 
 
 
293 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1777  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.32 
 
 
295 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  0.552551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00459  tartronate semialdehyde reductase, NADH-dependent  36.5 
 
 
292 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3103  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.5 
 
 
292 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0610  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.5 
 
 
292 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3113  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.5 
 
 
292 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.327741 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0957  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.69 
 
 
305 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.13 
 
 
292 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.39 
 
 
309 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00464  hypothetical protein  36.5 
 
 
292 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1975  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.31 
 
 
291 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.154488  hitchhiker  0.00242573 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0546  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.5 
 
 
292 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3831  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.5 
 
 
296 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45020  putative oxidoreductase  36.5 
 
 
296 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.820061  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2619  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  36.43 
 
 
291 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000383658  hitchhiker  0.000000335246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2487  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.16 
 
 
288 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2489  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  35.79 
 
 
291 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>