35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5223 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5223  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  350  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5061  hypothetical protein  96.74 
 
 
184 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3306  hypothetical protein  96.74 
 
 
184 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0602  hypothetical protein  90.76 
 
 
184 aa  279  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4471  hypothetical protein  87.5 
 
 
184 aa  257  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4996  hypothetical protein  87.5 
 
 
184 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.351525  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3810  hypothetical protein  76.06 
 
 
188 aa  195  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.889398 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3581  methylamine utilisation MauE  76.68 
 
 
193 aa  194  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  40.16 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  42.77 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  38.53 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  36 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2223  methylamine utilisation MauE  35.75 
 
 
178 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4731  methylamine utilisation MauE  42.73 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0586854  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  38.71 
 
 
140 aa  55.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  36.54 
 
 
152 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  29.91 
 
 
153 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  38.1 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  40 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  37.93 
 
 
228 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  38.14 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  32.38 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  29.13 
 
 
140 aa  45.1  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0159  hypothetical protein  28.93 
 
 
173 aa  44.7  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  33.96 
 
 
138 aa  44.7  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  28.89 
 
 
159 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4079  hypothetical protein  36.59 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  35.37 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  34.44 
 
 
145 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  33.05 
 
 
173 aa  42  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  36.28 
 
 
174 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  31.5 
 
 
138 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  33.63 
 
 
142 aa  41.6  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  35.4 
 
 
174 aa  41.2  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  31.4 
 
 
167 aa  40.8  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>