42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3775 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  100 
 
 
853 aa  1766    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  88.46 
 
 
858 aa  1562    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  88.46 
 
 
858 aa  1562    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  25.52 
 
 
856 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  24.33 
 
 
852 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  25.03 
 
 
893 aa  189  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  25.19 
 
 
875 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  23.07 
 
 
880 aa  140  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1283  hypothetical protein  28.01 
 
 
944 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0978442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  25.57 
 
 
862 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  26.47 
 
 
945 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3481  hypothetical protein  21.16 
 
 
671 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.278924 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  32.31 
 
 
947 aa  107  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  32.31 
 
 
947 aa  107  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  32.31 
 
 
947 aa  107  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  34.74 
 
 
870 aa  105  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  34.74 
 
 
953 aa  105  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  30.15 
 
 
960 aa  104  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  29.15 
 
 
1007 aa  101  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  28.42 
 
 
949 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  23.98 
 
 
1013 aa  94.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  25.7 
 
 
944 aa  92.8  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  25.05 
 
 
944 aa  92.4  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  29.02 
 
 
1160 aa  91.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  25.05 
 
 
945 aa  91.7  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  35.23 
 
 
966 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  24.9 
 
 
944 aa  89.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  30.6 
 
 
925 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2856  hypothetical protein  25.91 
 
 
1072 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.563865  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2201  hypothetical protein  25.46 
 
 
1082 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2278  hypothetical protein  22.02 
 
 
631 aa  63.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.262759  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02058  hypothetical protein  23.37 
 
 
832 aa  58.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224791  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01953  hypothetical protein  28.66 
 
 
1049 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01951  hypothetical protein  28 
 
 
252 aa  56.2  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3616  hypothetical protein  24.64 
 
 
996 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2612  hypothetical protein  24.64 
 
 
996 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0746297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  26.56 
 
 
996 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  26.04 
 
 
996 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3113  hypothetical protein  23.67 
 
 
996 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  26.07 
 
 
887 aa  48.5  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2115  hypothetical protein  25.76 
 
 
996 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0113  hypothetical protein  23.57 
 
 
1085 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>