More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5628 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_5993  pirin domain-containing protein  100 
 
 
283 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.134003 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5628  Pirin-like  100 
 
 
283 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6484  pirin domain-containing protein  97.53 
 
 
283 aa  550  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.711582 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7379  Pirin-like  84.13 
 
 
281 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5237  Pirin domain protein  54.24 
 
 
287 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3049  Pirin, N-terminal  52.81 
 
 
278 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0213029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3183  hypothetical protein  50.19 
 
 
278 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.406067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1968  Pirin domain protein  51.3 
 
 
290 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.0279036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0941  Pirin domain protein  47.64 
 
 
299 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2436  pirin  47.83 
 
 
130 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  32.94 
 
 
299 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  29.63 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  29.67 
 
 
306 aa  89  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  35.67 
 
 
285 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0677  hypothetical protein  27.87 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  29.66 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  32.69 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  29.31 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  27.62 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  30.43 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  32.74 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  28.89 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  27.9 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  29.02 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  29.66 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  29.61 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  28.51 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  31.68 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  30.89 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  30.89 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  30.89 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  27.88 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  27.44 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  25.86 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  25.86 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  25.86 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  30.88 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  28.57 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  28.57 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  27.47 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  26.72 
 
 
292 aa  79  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  27.47 
 
 
286 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  27.47 
 
 
286 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  29.04 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  30.69 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  27.04 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  27.97 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  29 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  31.52 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  31.58 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  30.71 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  29.5 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  27.69 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  35.48 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  32.51 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  26.52 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  31.11 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  34.59 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  32.79 
 
 
306 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  33.33 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  28.77 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  28.76 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  28.12 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  29.71 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  35.29 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  27.59 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  27.16 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  31.79 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  25.64 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  35.29 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  29.05 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  36.04 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  30.36 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  29.91 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  34.2 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  35.93 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  32.35 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  35.93 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  33.33 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  33.81 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  28.43 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  33.58 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  29.5 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  28.98 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  29.05 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  35.33 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1102  pirin domain-containing protein  31.13 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.596816  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  29.39 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  29.1 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  35.33 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  31.76 
 
 
302 aa  72  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  31.25 
 
 
283 aa  72  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  31.16 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  32.58 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  35.71 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  30.43 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  33.93 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  30.2 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  30.24 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  29.05 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>