More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1428 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1428  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 640 aa  1278    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922087  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6401  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 640 aa  1278    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7333  AMP-dependent synthetase and ligase  49.76 
 
 		 650 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1821  AMP-dependent synthetase and ligase  48.77 
 
 		 652 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6450  AMP-dependent synthetase and ligase  46.13 
 
 		 650 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  hitchhiker  0.0000000000000110833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  42.1 
 
 		 642 aa  503  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2222  AMP-dependent synthetase and ligase  42.26 
 
 		 641 aa  487  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  41.95 
 
 		 663 aa  483  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0770781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2554  acetoacetyl-CoA synthase, putative  39.25 
 
 		 646 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2292  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  39.25 
 
 		 646 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.365139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 		 646 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0926585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 		 646 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2517  putative acetoacetyl-CoA synthase  39.1 
 
 		 646 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2806  putative acetoacetyl-CoA synthase  39.07 
 
 		 646 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.846139  hitchhiker  0.00209693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2376  acetoacetyl-CoA synthase  39.25 
 
 		 646 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.381353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2333  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  39.25 
 
 		 646 aa  478  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2566  putative acetoacetyl-CoA synthase  39.25 
 
 		 646 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000120954 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2553  acetoacetyl-CoA synthase  39.25 
 
 		 646 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2609  putative acetoacetyl-CoA synthase  39.25 
 
 		 646 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3467  AMP-dependent synthetase and ligase  41.86 
 
 		 670 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7155  AMP-dependent synthetase and ligase  38.15 
 
 		 668 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2113  AMP-dependent synthetase and ligase  39.72 
 
 		 643 aa  417  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2788  AMP-dependent synthetase and ligase  33.7 
 
 		 608 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374642  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 670 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0166  AMP-dependent synthetase and ligase  39.77 
 
 		 623 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 608 aa  395  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0200095  normal  0.25307 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2583  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 		 674 aa  392  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319993  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  36.68 
 
 		 694 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2056  AMP-dependent synthetase and ligase  36.66 
 
 		 663 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0866  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 641 aa  360  4e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0265876 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  35.03 
 
 		 638 aa  342  9e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  34.35 
 
 		 649 aa  341  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  33.9 
 
 		 639 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  33.71 
 
 		 639 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  32.48 
 
 		 636 aa  328  3e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  33.28 
 
 		 650 aa  327  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  33.59 
 
 		 648 aa  325  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  32.45 
 
 		 651 aa  323  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  32.87 
 
 		 670 aa  323  5e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  32 
 
 		 636 aa  323  6e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  33.44 
 
 		 650 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  33.02 
 
 		 666 aa  321  3e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  31.74 
 
 		 636 aa  319  9e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  31.06 
 
 		 638 aa  318  2e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  32.95 
 
 		 653 aa  316  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 		 661 aa  315  1.9999999999999998e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  33.49 
 
 		 656 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  31.26 
 
 		 652 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  32.52 
 
 		 650 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  33.28 
 
 		 655 aa  313  5.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  32.31 
 
 		 660 aa  312  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  30.85 
 
 		 664 aa  311  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  32.96 
 
 		 659 aa  311  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  31.6 
 
 		 648 aa  311  2e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  31.26 
 
 		 652 aa  310  4e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  30.54 
 
 		 666 aa  309  9e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  32.06 
 
 		 652 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  32.92 
 
 		 668 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  33.71 
 
 		 658 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  33.65 
 
 		 654 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  33.07 
 
 		 657 aa  307  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  30.43 
 
 		 667 aa  308  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  32.4 
 
 		 666 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  33.83 
 
 		 654 aa  306  6e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  32.04 
 
 		 667 aa  306  6e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  31.3 
 
 		 667 aa  306  7e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  31.22 
 
 		 666 aa  306  9.000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1767  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 650 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898058  normal  0.363453 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  31.35 
 
 		 663 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  30.82 
 
 		 657 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2047  acetyl-coenzyme A synthetase  35.75 
 
 		 651 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  32.27 
 
 		 652 aa  303  6.000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  32.64 
 
 		 670 aa  303  6.000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  31.29 
 
 		 667 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  32.55 
 
 		 655 aa  302  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  31.83 
 
 		 631 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  31.96 
 
 		 664 aa  302  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  31.66 
 
 		 632 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  33.49 
 
 		 655 aa  301  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  34.08 
 
 		 661 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  31.66 
 
 		 632 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 664 aa  301  2e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  34.47 
 
 		 661 aa  301  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  33.86 
 
 		 655 aa  301  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  33.86 
 
 		 655 aa  301  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  32.32 
 
 		 660 aa  300  5e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  32.28 
 
 		 656 aa  299  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  32.78 
 
 		 629 aa  299  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  33.7 
 
 		 655 aa  298  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  29.68 
 
 		 652 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  33.02 
 
 		 657 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  33.23 
 
 		 662 aa  298  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  33.28 
 
 		 656 aa  298  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  29.68 
 
 		 652 aa  297  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3921  acetyl-CoA synthetase  29.68 
 
 		 652 aa  297  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  31.34 
 
 		 658 aa  297  5e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4619  acetyl-CoA synthetase  31.71 
 
 		 652 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.341691  normal  0.539786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4535  acetyl-CoA synthetase  31.71 
 
 		 652 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4621  acetyl-CoA synthetase  31.71 
 
 		 652 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  31.85 
 
 		 663 aa  296  8e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>