More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2554 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2554  ABC transporter related  100 
 
 		 369 aa  725    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  61.34 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5875  ABC transporter related protein  63.48 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0109503  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1719  ABC transporter related  57.98 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  43.8 
 
 		 365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  47.66 
 
 		 366 aa  312  6.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 371 aa  312  7.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  45.01 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 		 376 aa  309  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  44.73 
 
 		 355 aa  308  9e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  46.83 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  49.68 
 
 		 375 aa  305  6e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  46.96 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  45.6 
 
 		 358 aa  302  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  46.02 
 
 		 355 aa  302  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  49.03 
 
 		 375 aa  302  6.000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  46.24 
 
 		 355 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.7 
 
 		 359 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  45.08 
 
 		 385 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.94 
 
 		 349 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  44.77 
 
 		 375 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  42.19 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  46.7 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  45.45 
 
 		 358 aa  299  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  46.13 
 
 		 353 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.77 
 
 		 379 aa  300  4e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  45.86 
 
 		 353 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  45.68 
 
 		 354 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  46.43 
 
 		 360 aa  299  6e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  49.06 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  44.9 
 
 		 357 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  47.63 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.324815 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  46.01 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  45.15 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  49.84 
 
 		 363 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  44.93 
 
 		 364 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  45.83 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  46.11 
 
 		 353 aa  296  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  43.56 
 
 		 355 aa  295  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  49.84 
 
 		 356 aa  295  7e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  45.86 
 
 		 357 aa  295  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.92 
 
 		 369 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  44.85 
 
 		 354 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  44.2 
 
 		 360 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  43.7 
 
 		 384 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.17 
 
 		 367 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  46.11 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  42.36 
 
 		 369 aa  292  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  43.37 
 
 		 355 aa  292  6e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  44.05 
 
 		 373 aa  292  7e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  46.4 
 
 		 350 aa  292  8e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  44.85 
 
 		 354 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  43.82 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  45.11 
 
 		 353 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.81 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.54 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  45.88 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.81 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  47.79 
 
 		 360 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  44.06 
 
 		 378 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  44.41 
 
 		 356 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  43.51 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.32 
 
 		 358 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  45.82 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.28 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  45.86 
 
 		 360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  43.3 
 
 		 356 aa  289  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  43.16 
 
 		 384 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  43.3 
 
 		 356 aa  289  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.3 
 
 		 356 aa  288  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.3 
 
 		 356 aa  288  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.36 
 
 		 386 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.3 
 
 		 356 aa  288  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  43.7 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.19 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.54 
 
 		 361 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.3 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.3 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  46.06 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.54 
 
 		 361 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3495  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.26 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  42.35 
 
 		 386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  45.69 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  43.02 
 
 		 356 aa  286  5e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.11 
 
 		 365 aa  286  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  42.82 
 
 		 345 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  46.94 
 
 		 350 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  46.94 
 
 		 350 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  46.94 
 
 		 350 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  48.56 
 
 		 398 aa  285  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  46.94 
 
 		 353 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  44.41 
 
 		 359 aa  285  8e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  42.93 
 
 		 384 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  42.35 
 
 		 389 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.01 
 
 		 369 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  42.93 
 
 		 384 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  44.79 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>