180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1039 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
310 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  41.2 
 
 
285 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.5 
 
 
287 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
276 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.32 
 
 
283 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.32 
 
 
283 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.03 
 
 
312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.03 
 
 
312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.15 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.32 
 
 
314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  39 
 
 
241 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.59 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  36.81 
 
 
241 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.33 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.87 
 
 
322 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.21 
 
 
317 aa  105  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.09 
 
 
241 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 
302 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.24 
 
 
320 aa  99.4  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.26 
 
 
249 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.34 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.17 
 
 
250 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.36 
 
 
193 aa  84  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.21 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
303 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.76 
 
 
316 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  36.44 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  28.46 
 
 
336 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
296 aa  56.6  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0857  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.05 
 
 
350 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741421  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
311 aa  56.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  25.6 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.61 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3569  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.303688  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1520  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  27.16 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00376715  hitchhiker  3.69674e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
501 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
328 aa  52.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
342 aa  52.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 
324 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  28.87 
 
 
336 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3686  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.71 
 
 
307 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.38956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  26.67 
 
 
337 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.27 
 
 
292 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  27.92 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.61 
 
 
292 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
312 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  28.92 
 
 
337 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  34.78 
 
 
297 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 
328 aa  50.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.08 
 
 
330 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.86 
 
 
332 aa  50.1  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
317 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.46 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  25.42 
 
 
337 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
373 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.97 
 
 
332 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  30.28 
 
 
209 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.08 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.74 
 
 
336 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  25.3 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 
326 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0127971 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.56 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
411 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  28.4 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  29.36 
 
 
209 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
306 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 
321 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4699  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.9 
 
 
340 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
277 aa  46.6  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
373 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  31.63 
 
 
301 aa  46.2  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  28.26 
 
 
335 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 
315 aa  46.2  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 
302 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 
479 aa  46.2  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
322 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
311 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  32.14 
 
 
324 aa  45.8  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 
318 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.37 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
328 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>