More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0403 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
342 aa  681    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.66 
 
 
327 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  53.29 
 
 
329 aa  354  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.52 
 
 
333 aa  344  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.13 
 
 
350 aa  335  5.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.37 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
339 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.15 
 
 
339 aa  290  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.74 
 
 
335 aa  285  7e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  44.58 
 
 
327 aa  282  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.16 
 
 
326 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.95 
 
 
326 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.98 
 
 
336 aa  169  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
331 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
310 aa  112  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  32.13 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.13 
 
 
313 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
311 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
310 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
309 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
309 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  29.46 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  29.17 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  29.23 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 
746 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  22.66 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  27.13 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.08 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  21.26 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  20.78 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  25.9 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  21.26 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
296 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  26.25 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 
680 aa  65.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  29.17 
 
 
334 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  23.53 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
320 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
329 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000513582  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.38 
 
 
340 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 
294 aa  62.8  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
318 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.34 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  26.42 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.72 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
345 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
301 aa  61.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.47 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0024  UDP-glucose 4-epimerase  31.87 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  24.9 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
347 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
329 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
332 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.85 
 
 
340 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 
341 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  31.03 
 
 
345 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43121  predicted protein  26.29 
 
 
333 aa  59.7  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154535 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43341  predicted protein  26.29 
 
 
333 aa  59.7  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0269246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  27.16 
 
 
324 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  30.17 
 
 
340 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  30.17 
 
 
340 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.4 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1237  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.94 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000110601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  32.52 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 
295 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.55 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  29.31 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 
315 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  29.57 
 
 
340 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0632  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43169  predicted protein  25.11 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0856686  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  28.93 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  28.93 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>