More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0348 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  100 
 
 
698 aa  1386    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  40 
 
 
745 aa  410  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  34.99 
 
 
713 aa  361  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  37.06 
 
 
723 aa  354  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  36.75 
 
 
720 aa  351  3e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.2 
 
 
751 aa  350  7e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.2 
 
 
747 aa  350  7e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  36.2 
 
 
751 aa  349  8e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.35 
 
 
753 aa  349  8e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  36.2 
 
 
753 aa  349  9e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.2 
 
 
751 aa  349  9e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.2 
 
 
751 aa  349  9e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.2 
 
 
747 aa  349  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.2 
 
 
753 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.68 
 
 
732 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  39.47 
 
 
731 aa  346  7e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.2 
 
 
747 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.05 
 
 
741 aa  345  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  38.48 
 
 
735 aa  343  5e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34 
 
 
755 aa  342  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  34.32 
 
 
762 aa  340  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  34.42 
 
 
739 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  33.28 
 
 
741 aa  338  9.999999999999999e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  34.89 
 
 
744 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  34.98 
 
 
726 aa  337  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  35.2 
 
 
778 aa  337  7e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  32.77 
 
 
768 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.06 
 
 
795 aa  335  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.52 
 
 
794 aa  335  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  33.13 
 
 
723 aa  334  3e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  33.64 
 
 
721 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.57 
 
 
765 aa  334  4e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  32.63 
 
 
741 aa  333  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  33.13 
 
 
744 aa  333  6e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  33.28 
 
 
759 aa  333  6e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.8 
 
 
742 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.08 
 
 
772 aa  333  8e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.04 
 
 
729 aa  332  1e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  31.45 
 
 
735 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  32.88 
 
 
728 aa  331  3e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  32.82 
 
 
723 aa  330  5.0000000000000004e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.48 
 
 
763 aa  330  7e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  30.84 
 
 
726 aa  330  8e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  34.49 
 
 
726 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  33.9 
 
 
709 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  33.9 
 
 
709 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  35.25 
 
 
773 aa  329  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.38 
 
 
731 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  32.22 
 
 
728 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  31.59 
 
 
721 aa  327  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.55 
 
 
673 aa  327  5e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.19 
 
 
788 aa  327  5e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  32.19 
 
 
737 aa  327  7e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  32.06 
 
 
720 aa  326  9e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.93 
 
 
833 aa  325  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.95 
 
 
711 aa  326  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  34.96 
 
 
736 aa  326  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  34.24 
 
 
727 aa  326  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.8 
 
 
838 aa  325  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.64 
 
 
783 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  33.78 
 
 
751 aa  326  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  33.79 
 
 
765 aa  325  2e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  32 
 
 
720 aa  325  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  32.49 
 
 
728 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  31.64 
 
 
783 aa  324  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  33.8 
 
 
727 aa  324  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.45 
 
 
787 aa  324  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  37.07 
 
 
625 aa  324  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.56 
 
 
725 aa  324  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.57 
 
 
786 aa  324  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  32.49 
 
 
728 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.51 
 
 
817 aa  324  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  36.16 
 
 
735 aa  323  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  32.12 
 
 
730 aa  323  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  31.77 
 
 
720 aa  323  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  31.94 
 
 
724 aa  323  8e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  31.62 
 
 
720 aa  323  9.000000000000001e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  31.3 
 
 
787 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.23 
 
 
730 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  33.07 
 
 
770 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.42 
 
 
773 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  33.7 
 
 
728 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.23 
 
 
730 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  31.16 
 
 
846 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  33.59 
 
 
787 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  31.16 
 
 
787 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  33.77 
 
 
728 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  31.21 
 
 
721 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.61 
 
 
762 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  31.5 
 
 
787 aa  321  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  35.62 
 
 
807 aa  321  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  34.6 
 
 
721 aa  321  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  32.37 
 
 
809 aa  321  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  31.5 
 
 
787 aa  321  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  31.5 
 
 
787 aa  321  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  32.34 
 
 
728 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.95 
 
 
725 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  31.5 
 
 
787 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.25 
 
 
785 aa  320  5e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  31.5 
 
 
787 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>