37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3345 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3955  hypothetical protein  68.52 
 
 		 708 aa  683    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3345  hypothetical protein  100 
 
 		 694 aa  1298    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3850  hypothetical protein  89.77 
 
 		 685 aa  938    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.618617 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3573  hypothetical protein  66.39 
 
 		 710 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338057  normal  0.799979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4412  hypothetical protein  68.52 
 
 		 708 aa  683    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2128  hypothetical protein  66.26 
 
 		 802 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00604718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4625  hypothetical protein  62.3 
 
 		 752 aa  259  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2448  hypothetical protein  77.27 
 
 		 882 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.564795  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0676  transmembrane protein  77.38 
 
 		 844 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1646  hypothetical protein  77.38 
 
 		 875 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1855  hypothetical protein  77.38 
 
 		 875 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0264173  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2310  hypothetical protein  77.38 
 
 		 881 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0772  hypothetical protein  77.38 
 
 		 881 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0526  hypothetical protein  77.38 
 
 		 875 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1724  hypothetical protein  77.38 
 
 		 190 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4371  hypothetical protein  68.75 
 
 		 783 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6845  hypothetical protein  48.86 
 
 		 890 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000661999  normal  0.206537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2884  hypothetical protein  42.51 
 
 		 882 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677887  normal  0.937663 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 		 940 aa  52.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  43.1 
 
 		 962 aa  49.7  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  48.84 
 
 		 968 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  48.84 
 
 		 969 aa  48.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  53.49 
 
 		 722 aa  47.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  53.49 
 
 		 731 aa  47.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  48.98 
 
 		 822 aa  47  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  34.51 
 
 		 1041 aa  46.2  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 952 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  45.65 
 
 		 1036 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  52.27 
 
 		 806 aa  45.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  51.11 
 
 		 883 aa  45.8  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  45.45 
 
 		 947 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  45.45 
 
 		 948 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  40.91 
 
 		 946 aa  45.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  42.86 
 
 		 888 aa  44.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  40.35 
 
 		 673 aa  43.9  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  43.18 
 
 		 911 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  36.67 
 
 		 1027 aa  43.9  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>