29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1852 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  51.01 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  49.66 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  48.99 
 
 		 158 aa  141  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  48.99 
 
 		 158 aa  141  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  49.66 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  51.66 
 
 		 163 aa  140  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  49.67 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  46.36 
 
 		 165 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  46.36 
 
 		 165 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  45.45 
 
 		 163 aa  130  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  47.68 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  43.14 
 
 		 163 aa  124  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  46.81 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  46.94 
 
 		 179 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  50.55 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  37.41 
 
 		 274 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00139  endolysin  60.61 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10006  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  34.75 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  34.29 
 
 		 630 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  39.77 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  34.48 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  34.13 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  33.07 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  31.03 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  33.08 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0924  hypothetical protein  43.96 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  33.1 
 
 		 239 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1543  glycoside hydrolase family 24  28.48 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>