40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5635 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5635  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  100 
 
 		 335 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0813541 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5852  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  95.22 
 
 		 335 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0423  type III secretion system protein HrpB  40.87 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00673327  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1899  type III secretion system protein HrpB  41.74 
 
 		 270 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1991  type III secretion system protein HrpB  41.74 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5938  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  38.49 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0745  type III secretion system protein HrpB  39.82 
 
 		 238 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0685  type III secretion system protein HrpB  39.37 
 
 		 238 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129872  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2204  type III secretion system protein HrpB  38.91 
 
 		 240 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0628  type III secretion system protein HrpB  38.91 
 
 		 240 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1636  type III secretion system protein HrpB  38.91 
 
 		 238 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2287  type III secretion system protein HrpB  38.91 
 
 		 238 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0183918  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1949  type III secretion system protein HrpB  43.1 
 
 		 215 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03397  type III secretion system protein HrpB  35.98 
 
 		 233 aa  98.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0869  type III secretion system protein HrpB  39.91 
 
 		 301 aa  95.9  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371286  decreased coverage  0.00150472 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0464  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  38.61 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3746  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  33.94 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212499  hitchhiker  0.00667574 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  29.93 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  25.14 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4745  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  32.72 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.528631 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5436  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  32.1 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0949322  normal  0.0915809 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4848  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  32.1 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4223  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  32.72 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3518  Type III secretion system HrpE/YscL  32.1 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253777  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  24.28 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  29.22 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42250  type III secretion system protein  33.33 
 
 		 214 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  21.74 
 
 		 262 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  23.24 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  21.52 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  26.46 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  36.49 
 
 		 242 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  32.03 
 
 		 268 aa  46.6  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  25.59 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  29.95 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2715  hypothetical protein  21.2 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  31.78 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1289  hypothetical protein  31.21 
 
 		 217 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.630494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  20.57 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2345  flagellar assembly protein FliH  42.25 
 
 		 226 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>